37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1438 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1438  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  266  5e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371938  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1395  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  266  5e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.549071  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1737  hypothetical protein  93.23 
 
 
133 aa  251  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2089  hypothetical protein  42.54 
 
 
132 aa  98.6  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00742769 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2014  hypothetical protein  45.38 
 
 
128 aa  97.8  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2861  hypothetical protein  49.04 
 
 
166 aa  97.1  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.898114  normal  0.0144994 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2601  hypothetical protein  46.15 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.415207  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0954  hypothetical protein  39.81 
 
 
134 aa  89.7  1e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.353325  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2898  hypothetical protein  39.72 
 
 
139 aa  87.8  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5470  hypothetical protein  35.16 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0809121  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1851  hypothetical protein  33.98 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5103  hypothetical protein  31.58 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4640  hypothetical protein  31.58 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0336468 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2364  hypothetical protein  31.25 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal  0.0631893 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0262  hypothetical protein  38.95 
 
 
164 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.042109  normal  0.0475233 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3478  hypothetical protein  36.84 
 
 
126 aa  67  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5179  putative exported protein of unknown function  32.11 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1987  hypothetical protein  30.65 
 
 
127 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0646582  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2187  hypothetical protein  31.96 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0734029  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1044  hypothetical protein  32.63 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1272  hypothetical protein  33.68 
 
 
126 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6181  hypothetical protein  31.3 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.356695 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4055  hypothetical protein  29.03 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0047292  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3401  hypothetical protein  31.25 
 
 
127 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0669705  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0957  secreted (periplasmic) protein-like  32.63 
 
 
156 aa  54.3  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2414  hypothetical protein  31.18 
 
 
123 aa  53.5  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0685  hypothetical protein  35.79 
 
 
130 aa  52.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.173573 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0056  secreted (periplasmic) protein-like protein  32.56 
 
 
289 aa  47.8  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0584  hypothetical protein  32.86 
 
 
127 aa  47.4  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.206674  normal  0.156127 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2768  hypothetical protein  29.7 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.36439  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0684  hypothetical protein  26.58 
 
 
119 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.428202  normal  0.243633 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0773  putative FtsL  25.32 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.440113  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2016  hypothetical protein  30.21 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2097  putative FtsL  25.32 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3674  hypothetical protein  40.62 
 
 
148 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.168814 
 
 
-
 
NC_002978  WD0171  hypothetical protein  28.57 
 
 
103 aa  40.4  0.007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.014159  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3177  putative inner-membrane translocator  25.84 
 
 
284 aa  40.4  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.523516  normal  0.620402 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>