37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1044 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1044  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  253  6e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1272  hypothetical protein  91.27 
 
 
126 aa  234  4e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2187  hypothetical protein  73.17 
 
 
126 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0734029  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3401  hypothetical protein  69.84 
 
 
127 aa  181  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0669705  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1987  hypothetical protein  68.25 
 
 
127 aa  181  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0646582  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4055  hypothetical protein  65.87 
 
 
127 aa  175  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0047292  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6181  hypothetical protein  63.96 
 
 
130 aa  155  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.356695 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1851  hypothetical protein  37.27 
 
 
203 aa  86.7  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5470  hypothetical protein  39.56 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0809121  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5103  hypothetical protein  41.76 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2364  hypothetical protein  42.86 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal  0.0631893 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4640  hypothetical protein  41.76 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0336468 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0262  hypothetical protein  38.89 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.042109  normal  0.0475233 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5179  putative exported protein of unknown function  40.66 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3478  hypothetical protein  33.64 
 
 
126 aa  73.6  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2414  hypothetical protein  34.58 
 
 
123 aa  67.8  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1737  hypothetical protein  33.68 
 
 
133 aa  63.9  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0957  secreted (periplasmic) protein-like  32.22 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1395  hypothetical protein  32.63 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.549071  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1438  hypothetical protein  32.63 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371938  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0954  hypothetical protein  29.82 
 
 
134 aa  58.2  0.00000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.353325  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3177  putative inner-membrane translocator  35.16 
 
 
284 aa  57  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.523516  normal  0.620402 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2768  hypothetical protein  32.97 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.36439  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2014  hypothetical protein  26.15 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2473  hypothetical protein  32.74 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.540136 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0685  hypothetical protein  32.32 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.173573 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0684  hypothetical protein  36.9 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.428202  normal  0.243633 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2097  putative FtsL  33.33 
 
 
119 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0773  putative FtsL  33.33 
 
 
119 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.440113  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0584  hypothetical protein  31.68 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.206674  normal  0.156127 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2861  hypothetical protein  28.57 
 
 
166 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.898114  normal  0.0144994 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2085  hypothetical protein  40.91 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.975572  normal  0.306975 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2089  hypothetical protein  30 
 
 
132 aa  47.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00742769 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2898  hypothetical protein  28.57 
 
 
139 aa  47  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2601  hypothetical protein  26.37 
 
 
157 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.415207  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0056  secreted (periplasmic) protein-like protein  27.27 
 
 
289 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2016  hypothetical protein  30.3 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>