27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3177 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3177  putative inner-membrane translocator  100 
 
 		 284 aa  547  1e-155  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.523516  normal  0.620402 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0056  secreted (periplasmic) protein-like protein  37.76 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4055  hypothetical protein  37.89 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0047292  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3478  hypothetical protein  30.19 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0685  hypothetical protein  38.1 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.173573 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1987  hypothetical protein  33.02 
 
 		 127 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0646582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6181  hypothetical protein  31.82 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.356695 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1044  hypothetical protein  35.16 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3401  hypothetical protein  34.78 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0669705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1272  hypothetical protein  35.16 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2187  hypothetical protein  32.52 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0734029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0262  hypothetical protein  34.58 
 
 		 164 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.042109  normal  0.0475233 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2768  hypothetical protein  35.29 
 
 		 119 aa  54.7  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.36439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5470  hypothetical protein  34.26 
 
 		 153 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0809121  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5179  putative exported protein of unknown function  31.52 
 
 		 143 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0171  hypothetical protein  29.67 
 
 		 103 aa  52.4  0.000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.014159  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2414  hypothetical protein  31.45 
 
 		 123 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5103  hypothetical protein  30.43 
 
 		 143 aa  52  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4640  hypothetical protein  30.43 
 
 		 143 aa  52  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336468 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0957  secreted (periplasmic) protein-like  27.17 
 
 		 156 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2861  hypothetical protein  22.83 
 
 		 166 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.898114  normal  0.0144994 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2364  hypothetical protein  31.87 
 
 		 137 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal  0.0631893 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2898  hypothetical protein  30.26 
 
 		 139 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2473  hypothetical protein  33.72 
 
 		 118 aa  46.2  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.540136 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0584  hypothetical protein  30.69 
 
 		 127 aa  44.3  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.206674  normal  0.156127 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2601  hypothetical protein  22.83 
 
 		 157 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.415207  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2089  hypothetical protein  25.93 
 
 		 132 aa  42.4  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742769 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>