35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1987 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1987  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  256  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0646582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3401  hypothetical protein  87.4 
 
 		 127 aa  233  9e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0669705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4055  hypothetical protein  81.89 
 
 		 127 aa  217  5e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0047292  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2187  hypothetical protein  73.02 
 
 		 126 aa  193  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0734029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1272  hypothetical protein  70.73 
 
 		 126 aa  183  8e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1044  hypothetical protein  68.25 
 
 		 126 aa  181  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6181  hypothetical protein  70.27 
 
 		 130 aa  163  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.356695 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5470  hypothetical protein  40.54 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0809121  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1851  hypothetical protein  37.84 
 
 		 203 aa  84  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0262  hypothetical protein  43.96 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.042109  normal  0.0475233 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4640  hypothetical protein  44.57 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5103  hypothetical protein  44.57 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2364  hypothetical protein  42.39 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal  0.0631893 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5179  putative exported protein of unknown function  43.48 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3478  hypothetical protein  39.56 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0957  secreted (periplasmic) protein-like  32.97 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2414  hypothetical protein  35.96 
 
 		 123 aa  63.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1737  hypothetical protein  30.47 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0954  hypothetical protein  30.43 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.353325  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1395  hypothetical protein  30.65 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.549071  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1438  hypothetical protein  30.65 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371938  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3177  putative inner-membrane translocator  33.02 
 
 		 284 aa  58.2  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.523516  normal  0.620402 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0685  hypothetical protein  35.71 
 
 		 130 aa  57  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.173573 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2014  hypothetical protein  28.35 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2861  hypothetical protein  32.61 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.898114  normal  0.0144994 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2601  hypothetical protein  31.52 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.415207  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2089  hypothetical protein  33.7 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742769 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2768  hypothetical protein  31.58 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.36439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2473  hypothetical protein  31.31 
 
 		 118 aa  50.4  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.540136 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2898  hypothetical protein  32.61 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0584  hypothetical protein  30.59 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.206674  normal  0.156127 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0773  putative FtsL  31.43 
 
 		 119 aa  42.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.440113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2097  putative FtsL  31.43 
 
 		 119 aa  42.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0171  hypothetical protein  23.91 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.014159  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0684  hypothetical protein  29.63 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.428202  normal  0.243633 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>