25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2473 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2473  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  239  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.540136 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2097  putative FtsL  58.76 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0773  putative FtsL  58.76 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.440113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0684  hypothetical protein  57.73 
 
 		 119 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.428202  normal  0.243633 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2016  hypothetical protein  54.95 
 
 		 115 aa  114  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0584  hypothetical protein  56 
 
 		 127 aa  110  9e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.206674  normal  0.156127 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2768  hypothetical protein  48.31 
 
 		 119 aa  90.5  8e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.36439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1044  hypothetical protein  32.74 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2187  hypothetical protein  33.93 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0734029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6181  hypothetical protein  32.17 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.356695 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5179  putative exported protein of unknown function  37.21 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0262  hypothetical protein  37.21 
 
 		 164 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.042109  normal  0.0475233 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1987  hypothetical protein  31.31 
 
 		 127 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0646582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5470  hypothetical protein  34.94 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0809121  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2414  hypothetical protein  31.91 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1272  hypothetical protein  30.09 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4640  hypothetical protein  36.05 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5103  hypothetical protein  36.05 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2364  hypothetical protein  36.05 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal  0.0631893 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4055  hypothetical protein  32.32 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0047292  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3478  hypothetical protein  33.75 
 
 		 126 aa  47.4  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3177  putative inner-membrane translocator  33.72 
 
 		 284 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.523516  normal  0.620402 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3401  hypothetical protein  28.28 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0669705  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0171  hypothetical protein  36.21 
 
 		 103 aa  42  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.014159  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0957  secreted (periplasmic) protein-like  31.51 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>