28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0684 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0684  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  236  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.428202  normal  0.243633 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2097  putative FtsL  92.44 
 
 		 119 aa  224  4e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0773  putative FtsL  92.44 
 
 		 119 aa  224  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.440113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2016  hypothetical protein  62.75 
 
 		 115 aa  127  8.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0584  hypothetical protein  60.64 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.206674  normal  0.156127 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2473  hypothetical protein  57.73 
 
 		 118 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.540136 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2768  hypothetical protein  54.44 
 
 		 119 aa  102  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.36439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2414  hypothetical protein  35.96 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1044  hypothetical protein  36.9 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1272  hypothetical protein  34.52 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0957  secreted (periplasmic) protein-like  31.87 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1737  hypothetical protein  27.85 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5179  putative exported protein of unknown function  38.71 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0262  hypothetical protein  37.7 
 
 		 164 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.042109  normal  0.0475233 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5103  hypothetical protein  38.71 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4640  hypothetical protein  38.71 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336468 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1395  hypothetical protein  26.58 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.549071  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3478  hypothetical protein  32.91 
 
 		 126 aa  44.7  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1438  hypothetical protein  26.58 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371938  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5470  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0809121  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2364  hypothetical protein  40 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal  0.0631893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6181  hypothetical protein  30.95 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.356695 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4055  hypothetical protein  33.01 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0047292  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1987  hypothetical protein  29.63 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0646582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2187  hypothetical protein  31.37 
 
 		 126 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0734029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0685  hypothetical protein  38.46 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.173573 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3401  hypothetical protein  32.26 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0669705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2014  hypothetical protein  23.89 
 
 		 128 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>