24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2016 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2016  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  232  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2097  putative FtsL  64 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0773  putative FtsL  64 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.440113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0684  hypothetical protein  62.75 
 
 		 119 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.428202  normal  0.243633 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2473  hypothetical protein  54.95 
 
 		 118 aa  114  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.540136 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0584  hypothetical protein  55.32 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.206674  normal  0.156127 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2768  hypothetical protein  51.14 
 
 		 119 aa  98.2  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.36439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2414  hypothetical protein  36.36 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0957  secreted (periplasmic) protein-like  37.8 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3478  hypothetical protein  32.91 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5179  putative exported protein of unknown function  31.63 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0685  hypothetical protein  31.63 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.173573 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5103  hypothetical protein  32.65 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4640  hypothetical protein  32.65 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336468 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2364  hypothetical protein  33.67 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal  0.0631893 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0954  hypothetical protein  30 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.353325  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1044  hypothetical protein  30.3 
 
 		 126 aa  42.7  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_004310  BR1438  hypothetical protein  30.21 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371938  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0262  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.042109  normal  0.0475233 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1395  hypothetical protein  30.21 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.549071  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6181  hypothetical protein  29.63 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.356695 
 
 
-
 
NC_002978  WD0171  hypothetical protein  33.33 
 
 		 103 aa  41.2  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.014159  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5470  hypothetical protein  30.3 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0809121  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1272  hypothetical protein  34.62 
 
 		 126 aa  40  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>