35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2768 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2768  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  239  9e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.36439  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2097  putative FtsL  54.44 
 
 
119 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0684  hypothetical protein  54.44 
 
 
119 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.428202  normal  0.243633 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0773  putative FtsL  54.44 
 
 
119 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.440113  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2016  hypothetical protein  51.14 
 
 
115 aa  98.2  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0584  hypothetical protein  48.91 
 
 
127 aa  97.4  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.206674  normal  0.156127 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2473  hypothetical protein  48.31 
 
 
118 aa  90.5  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.540136 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2414  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2364  hypothetical protein  29.66 
 
 
137 aa  57  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal  0.0631893 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1044  hypothetical protein  32.97 
 
 
126 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0957  secreted (periplasmic) protein-like  32.97 
 
 
156 aa  55.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3177  putative inner-membrane translocator  35.29 
 
 
284 aa  54.7  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.523516  normal  0.620402 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5470  hypothetical protein  34.07 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0809121  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0685  hypothetical protein  37.84 
 
 
130 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.173573 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3478  hypothetical protein  28.57 
 
 
126 aa  51.2  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1987  hypothetical protein  31.58 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0646582  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1272  hypothetical protein  30.77 
 
 
126 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3401  hypothetical protein  35.16 
 
 
127 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0669705  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0262  hypothetical protein  32.97 
 
 
164 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.042109  normal  0.0475233 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4055  hypothetical protein  31.87 
 
 
127 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0047292  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2187  hypothetical protein  32.97 
 
 
126 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0734029  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5179  putative exported protein of unknown function  26.55 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2014  hypothetical protein  30.48 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6181  hypothetical protein  28.12 
 
 
130 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.356695 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5103  hypothetical protein  27.47 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1395  hypothetical protein  29.7 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.549071  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4640  hypothetical protein  27.47 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0336468 
 
 
-
 
NC_004310  BR1438  hypothetical protein  29.7 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371938  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0954  hypothetical protein  30 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.353325  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1737  hypothetical protein  28.7 
 
 
133 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2898  hypothetical protein  33.87 
 
 
139 aa  43.5  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2089  hypothetical protein  26.09 
 
 
132 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00742769 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2601  hypothetical protein  25 
 
 
157 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.415207  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0056  secreted (periplasmic) protein-like protein  26.19 
 
 
289 aa  41.2  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2861  hypothetical protein  23.91 
 
 
166 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.898114  normal  0.0144994 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>