37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4055 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4055  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  253  9e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0047292  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3401  hypothetical protein  82.68 
 
 		 127 aa  220  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0669705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1987  hypothetical protein  81.89 
 
 		 127 aa  217  5e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0646582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2187  hypothetical protein  72.36 
 
 		 126 aa  184  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0734029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1044  hypothetical protein  65.87 
 
 		 126 aa  175  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1272  hypothetical protein  66.67 
 
 		 126 aa  174  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6181  hypothetical protein  62.31 
 
 		 130 aa  157  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.356695 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5470  hypothetical protein  37.1 
 
 		 153 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0809121  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0262  hypothetical protein  43.96 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.042109  normal  0.0475233 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5103  hypothetical protein  44.57 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4640  hypothetical protein  44.57 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336468 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1851  hypothetical protein  36.04 
 
 		 203 aa  80.5  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2364  hypothetical protein  43.48 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal  0.0631893 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5179  putative exported protein of unknown function  43.48 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3478  hypothetical protein  40.66 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3177  putative inner-membrane translocator  37.89 
 
 		 284 aa  63.9  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.523516  normal  0.620402 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2414  hypothetical protein  35.96 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0957  secreted (periplasmic) protein-like  28.57 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1737  hypothetical protein  29.03 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2014  hypothetical protein  29.13 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0954  hypothetical protein  30.43 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.353325  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0685  hypothetical protein  34.69 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.173573 
 
 
-
 
NC_004310  BR1438  hypothetical protein  29.03 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371938  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1395  hypothetical protein  29.03 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.549071  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2861  hypothetical protein  31.52 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.898114  normal  0.0144994 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2601  hypothetical protein  30.43 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.415207  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2898  hypothetical protein  33.02 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2768  hypothetical protein  31.87 
 
 		 119 aa  50.4  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.36439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2089  hypothetical protein  32.61 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742769 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0584  hypothetical protein  36.47 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.206674  normal  0.156127 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2473  hypothetical protein  32.32 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.540136 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0684  hypothetical protein  33.01 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.428202  normal  0.243633 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2085  hypothetical protein  39.39 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.975572  normal  0.306975 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0056  secreted (periplasmic) protein-like protein  32.22 
 
 		 289 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0171  hypothetical protein  25 
 
 		 103 aa  40.4  0.007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.014159  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0773  putative FtsL  33 
 
 		 119 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.440113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2097  putative FtsL  33 
 
 		 119 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>