18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0056 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0056  secreted (periplasmic) protein-like protein  100 
 
 		 289 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3177  putative inner-membrane translocator  36.8 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.523516  normal  0.620402 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0957  secreted (periplasmic) protein-like  37.65 
 
 		 156 aa  65.1  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2601  hypothetical protein  32.03 
 
 		 157 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.415207  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2861  hypothetical protein  31.88 
 
 		 166 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.898114  normal  0.0144994 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2089  hypothetical protein  32.89 
 
 		 132 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742769 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2014  hypothetical protein  29.2 
 
 		 128 aa  53.1  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2414  hypothetical protein  30.19 
 
 		 123 aa  51.6  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3478  hypothetical protein  30.95 
 
 		 126 aa  50.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1438  hypothetical protein  32.56 
 
 		 133 aa  47  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371938  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1395  hypothetical protein  32.56 
 
 		 133 aa  47  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.549071  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2898  hypothetical protein  32.79 
 
 		 139 aa  46.6  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0685  hypothetical protein  37.14 
 
 		 130 aa  45.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.173573 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0584  hypothetical protein  30.21 
 
 		 127 aa  43.5  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.206674  normal  0.156127 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1737  hypothetical protein  31.4 
 
 		 133 aa  43.5  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1044  hypothetical protein  27.18 
 
 		 126 aa  43.1  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4055  hypothetical protein  32.22 
 
 		 127 aa  42.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0047292  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  24.85 
 
 		 1218 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>