More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2101 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2101  putative Atrazine chlorohydrolase  100 
 
 
457 aa  918    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.908269  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3147  N-ethylammeline chlorohydrolase  32.08 
 
 
495 aa  170  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1599  Atrazine chlorohydrolase  27.49 
 
 
434 aa  169  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.748458  unclonable  4.4345400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5805  amidohydrolase  32.01 
 
 
488 aa  162  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.494829  normal  0.718811 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1611  amidohydrolase  30.95 
 
 
445 aa  160  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170905  decreased coverage  0.00285374 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1326  putative amidohydrolase  29.41 
 
 
469 aa  157  6e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.183481  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  28.19 
 
 
440 aa  152  1e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  27.51 
 
 
431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  29.83 
 
 
428 aa  147  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  26.59 
 
 
434 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  29.36 
 
 
430 aa  147  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  28.44 
 
 
439 aa  147  6e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0896  amidohydrolase  27.69 
 
 
468 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  29.63 
 
 
440 aa  145  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4853  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.7 
 
 
493 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308799  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0930  amidohydrolase  25.87 
 
 
426 aa  144  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000429502  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3132  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.73 
 
 
465 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.17 
 
 
465 aa  143  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1293  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.1 
 
 
469 aa  143  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2584  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.5 
 
 
465 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934679  normal  0.607445 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2323  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.47 
 
 
465 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3055  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.79 
 
 
452 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0415  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.55 
 
 
493 aa  141  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.169233 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1698  amidohydrolase family protein  27.97 
 
 
477 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0059  amidohydrolase  27.29 
 
 
448 aa  139  7e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.312881  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2167  amidohydrolase  25 
 
 
436 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0888971  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0754  amidohydrolase  29.24 
 
 
432 aa  138  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10670  guanine deaminase  24.38 
 
 
431 aa  137  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3262  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.05 
 
 
457 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2526  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.02 
 
 
476 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0262801  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0042  amidohydrolase  28.54 
 
 
426 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2422  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.02 
 
 
500 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2379  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.02 
 
 
476 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750758  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5267  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.77 
 
 
470 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2073  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.89 
 
 
470 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722851  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  30.07 
 
 
444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1980  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.24 
 
 
470 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0946323 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  24.76 
 
 
431 aa  133  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6122  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.24 
 
 
470 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1956  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.24 
 
 
470 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.56 
 
 
432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  26.09 
 
 
432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  29.41 
 
 
447 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1335  amidohydrolase  27.74 
 
 
442 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0728  putative hydrolase  27.19 
 
 
443 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951469  normal  0.721492 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1943  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.28 
 
 
470 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.821524  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1313  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.54 
 
 
470 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.023454 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1870  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.28 
 
 
470 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0172647 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1721  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.38 
 
 
439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0574  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.25 
 
 
441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1182  N-ethylammeline chlorohydrolase  24.78 
 
 
434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.335787  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1851  amidohydrolase  30.23 
 
 
432 aa  127  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1688  amidohydrolase  28 
 
 
440 aa  127  4.0000000000000003e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.126758 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3238  amidohydrolase  28.47 
 
 
444 aa  127  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2061  amidohydrolase  27.32 
 
 
433 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000262126  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0145  amidohydrolase  28.54 
 
 
432 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1294  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.18 
 
 
493 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1183  amidohydrolase  25.12 
 
 
422 aa  123  6e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0482  amidohydrolase  27.93 
 
 
416 aa  123  8e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.338769 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1515  amidohydrolase  27.78 
 
 
429 aa  122  9e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1486  amidohydrolase  27.39 
 
 
435 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0735  amidohydrolase  25.35 
 
 
422 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.30941 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0991  amidohydrolase  27.91 
 
 
413 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5790  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.12 
 
 
497 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.574512  hitchhiker  0.000478395 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1199  amidohydrolase  24.56 
 
 
431 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.242168  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1140  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.09 
 
 
454 aa  121  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1577  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.35 
 
 
455 aa  121  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0236916  unclonable  0.000000239085 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2064  amidohydrolase  30.05 
 
 
476 aa  120  3.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1186  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.36 
 
 
467 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000010565  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.91 
 
 
451 aa  120  6e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6206  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.05 
 
 
452 aa  120  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.85 
 
 
484 aa  120  7e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  24.83 
 
 
431 aa  119  7.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf580  cytosine deaminase  23.61 
 
 
435 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.239245  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1959  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.15 
 
 
444 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2080  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.25 
 
 
436 aa  119  9e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0559  chlorohydrolase family protein  26.74 
 
 
381 aa  119  9.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0702  chlorohydrolase family protein  28.7 
 
 
455 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1591  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.11 
 
 
461 aa  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0768  amidohydrolase  27.88 
 
 
442 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0368346  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23240  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.22 
 
 
444 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00576591 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2960  amidohydrolase  26.48 
 
 
458 aa  119  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0086  amidohydrolase  24.37 
 
 
422 aa  118  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0675  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.68 
 
 
452 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100326  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1812  Atrazine chlorohydrolase  27.29 
 
 
440 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4866  amidohydrolase  25.9 
 
 
660 aa  117  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1669  S-adenosylhomocysteine deaminase  25.66 
 
 
462 aa  117  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0911  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.91 
 
 
442 aa  116  8.999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03194  conserved hypothetical protein  27.36 
 
 
464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0669  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.98 
 
 
451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.806632  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3705  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.64 
 
 
451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  23.11 
 
 
428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3918  amidohydrolase  26.2 
 
 
442 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1419  amidohydrolase  27.17 
 
 
656 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1531  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.44 
 
 
439 aa  114  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6058  amidohydrolase  27.07 
 
 
479 aa  114  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.535728  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2226  amidohydrolase  24.52 
 
 
433 aa  114  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.306812 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1532  putative exported amidohydrolase  25.71 
 
 
462 aa  113  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.241269  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1475  amidohydrolase domain-containing protein  25 
 
 
444 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0938308  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2404  amidohydrolase  26.22 
 
 
432 aa  113  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.378859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>