26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_36020 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_36020  Transcriptional regulator Cro/CI-like protein  100 
 
 		 78 aa  156  7e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2325  helix-turn-helix domain-containing protein  92.31 
 
 		 98 aa  148  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2645  XRE family transcriptional regulator  90.79 
 
 		 95 aa  141  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.404416  normal  0.0532346 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0682  XRE family transcriptional regulator  87.18 
 
 		 97 aa  140  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3737  helix-turn-helix domain-containing protein  87.18 
 
 		 78 aa  139  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.40567  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1284  helix-turn-helix domain protein  91.78 
 
 		 96 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1874  transcriptional regulator, XRE family  88.16 
 
 		 101 aa  138  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2937  helix-turn-helix domain-containing protein  84.62 
 
 		 97 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.84966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1249  XRE family transcriptional regulator  86.84 
 
 		 101 aa  136  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0411153 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2729  helix-turn-helix domain-containing protein  84.62 
 
 		 97 aa  136  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.909696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3028  XRE family transcriptional regulator  84.62 
 
 		 97 aa  136  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2616  helix-turn-helix domain protein  82.05 
 
 		 97 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.220796  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2610  putative transcription regulator protein  89.04 
 
 		 96 aa  134  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1258  XRE family transcriptional regulator  74.67 
 
 		 96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  55.07 
 
 		 91 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979703 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4630  transcriptional regulator, PbsX family  55.56 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6378  PbsX family transcriptional regulator  51.39 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2350  helix-turn-helix domain-containing protein  51.47 
 
 		 91 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2246  hypothetical protein  58 
 
 		 117 aa  63.5  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4814  XRE family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 82 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.577182 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0716  DNA-binding protein  42.65 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2855  DNA-binding protein  44.78 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000899857  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3625  XRE family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 98 aa  52  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0043  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 98 aa  50.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4760  DNA-binding protein  36.23 
 
 		 146 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1935  Cro/CI family transcriptional regulator  38 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000287357 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>