48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0043 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0043  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 98 aa  194  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3625  XRE family transcriptional regulator  88.66 
 
 		 98 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4814  XRE family transcriptional regulator  62.96 
 
 		 82 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.577182 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6378  PbsX family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  39.56 
 
 		 91 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979703 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2246  hypothetical protein  46.34 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1284  helix-turn-helix domain protein  42.17 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2610  putative transcription regulator protein  40.96 
 
 		 96 aa  67  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0682  XRE family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 97 aa  67  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0716  DNA-binding protein  43.04 
 
 		 90 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1258  XRE family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2937  helix-turn-helix domain-containing protein  40.96 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.84966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3028  XRE family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2325  helix-turn-helix domain-containing protein  42.31 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2729  helix-turn-helix domain-containing protein  45.07 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.909696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2616  helix-turn-helix domain protein  43.66 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.220796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1249  XRE family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 101 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0411153 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1874  transcriptional regulator, XRE family  46.97 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2645  XRE family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.404416  normal  0.0532346 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2350  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4630  transcriptional regulator, PbsX family  39.71 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3737  helix-turn-helix domain-containing protein  45.31 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.40567  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36020  Transcriptional regulator Cro/CI-like protein  42.19 
 
 		 78 aa  50.4  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6563  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 72 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4760  DNA-binding protein  36.36 
 
 		 146 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5920  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2855  DNA-binding protein  37.14 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000899857  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1522  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 68 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.379498  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1427  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 68 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1444  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2436  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 68 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109963  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3404  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 424 aa  43.5  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2793  transcriptional regulator, XRE family  43.94 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1301  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405872  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5417  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.602876  normal  0.653324 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5036  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0024  helix-turn-helix domain-containing protein  36.07 
 
 		 80 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.720603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3185  transcriptional regulator, XRE family  31.94 
 
 		 421 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1396  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 230 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4832  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2403  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 75 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3290  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 67 aa  40.4  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605967 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0196  subunit S of type I restriction-modification system  38.98 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.525048 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1199  subunit S of type I restriction-modification system  38.98 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  38.36 
 
 		 83 aa  40  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0668  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 87 aa  40  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>