32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2805 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2805  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  778    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.404247  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5280  hypothetical protein  25.93 
 
 		 372 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.274903  normal  0.237691 
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  29.03 
 
 		 569 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2492  Rhomboid family protein  34.65 
 
 		 579 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  23.81 
 
 		 554 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0283  rhomboid family protein  29.61 
 
 		 190 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  32.46 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  27.92 
 
 		 519 aa  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0269  rhomboid family protein  29.68 
 
 		 190 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  30.32 
 
 		 190 aa  50.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  30.32 
 
 		 190 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  29.68 
 
 		 190 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  29.68 
 
 		 190 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  29.68 
 
 		 190 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2750  rhomboid family protein  27.34 
 
 		 369 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.717687 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  28.25 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  35.9 
 
 		 342 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  25.78 
 
 		 356 aa  48.5  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3159  Rhomboid family protein  30.34 
 
 		 228 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000555456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  31.03 
 
 		 225 aa  47  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  29.81 
 
 		 236 aa  46.2  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  31.4 
 
 		 342 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  25.49 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0235  rhomboid family protein  31.11 
 
 		 186 aa  44.7  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  30.85 
 
 		 386 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  28.06 
 
 		 223 aa  44.3  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0312  rhomboid family protein  30.85 
 
 		 206 aa  44.3  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000705799  hitchhiker  0.00414604 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  29.71 
 
 		 327 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0685  S54 family peptidase  25.56 
 
 		 625 aa  43.5  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.085166  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  27.27 
 
 		 371 aa  43.5  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2989  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.32 
 
 		 625 aa  42.7  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5244  Rhomboid family protein  32.5 
 
 		 306 aa  42.7  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159225  hitchhiker  0.00568338 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>