50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_R0031 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_R0031  tRNA-Pro  100 
 
 		 79 bp  157  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0055  tRNA-Pro  92.41 
 
 		 78 bp  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000146939  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0033  tRNA-Pro  88.61 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0013  tRNA-Pro  88.61 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.293207  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0033  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0026  tRNA-Pro  87.34 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000262192  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0045  tRNA-Pro  88.61 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000186753  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0035  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124879  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0031  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000153307  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0035  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000012695  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0031  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000674228  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0048  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0048  tRNA-Pro  87.3 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0049  tRNA-Pro  90.7 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0043  tRNA-Pro  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.411383 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0011  tRNA-Pro  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.497936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0008  tRNA-Pro  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152664  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0007  tRNA-Pro  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0040  tRNA-Pro  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.123101  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0058  tRNA-Pro  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210923  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0001  tRNA-Pro  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0049  tRNA-Pro  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0035  tRNA-Pro  96.67 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0012  tRNA-Pro  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0008  tRNA-Pro  91.11 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0009  tRNA-Pro  91.11 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.565399  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0009  tRNA-Pro  91.11 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0056  tRNA-Pro  92.68 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0009  tRNA-Pro  91.11 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.687606  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0043  tRNA-Asp  96.43 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0072  tRNA-Pro  96.43 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000117208  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0019  tRNA-Asp  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.4765400000000006e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0037  tRNA-His  90.7 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.740745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0023  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  0.736236 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0050  tRNA-Asp  100 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0047  tRNA-Asp  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.488675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0051  tRNA-Asp  100 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.681144  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0032  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0138154  hitchhiker  0.00000207581 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0041  tRNA-Asp  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0134468  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0042  tRNA-Pro  83.54 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.465816  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t07  tRNA-Asp  100 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.802625  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0019  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.461088  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0042  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000616467  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0021  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.979827  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0012  tRNA-Ile  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.021618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0048  tRNA-Ile  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.884933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0054  tRNA-Ile  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0022  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000263342  normal  0.454307 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0054  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.043428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>