16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_R0033 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_R0033  tRNA-Pro  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0055  tRNA-Pro  94.87 
 
 
78 bp  123  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000146939  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0026  tRNA-Pro  94.87 
 
 
78 bp  123  6e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000262192  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0033  tRNA-Pro  93.59 
 
 
78 bp  115  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0077  tRNA-Pro  93.59 
 
 
77 bp  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.98508e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0045  tRNA-Pro  92.31 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000186753  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0031  tRNA-Pro  93.75 
 
 
79 bp  71.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0029  tRNA-Pro  85.9 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0046  tRNA-OTHER  91.84 
 
 
71 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.165428  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0056  tRNA-Pro  95.56 
 
 
86 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0072  tRNA-Pro  100 
 
 
78 bp  56  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000117208  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0042  tRNA-Pro  83.33 
 
 
78 bp  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.465816  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0049  tRNA-Pro  85.96 
 
 
78 bp  50.1  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0045  tRNA-Pro  86.79 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0890762  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0027  tRNA-Pro  100 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000011857  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0030  tRNA-Pro  91.43 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135671  decreased coverage  0.0000000375958 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>