43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_R0029 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_R0029  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0033  tRNA-Pro  89.74 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0026  tRNA-Pro  88.46 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000262192  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0033  tRNA-Pro  85.9 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0077  tRNA-Pro  87.18 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.98508e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0055  tRNA-Pro  85.9 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000146939  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0056  tRNA-Pro  88.41 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0005  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0019  tRNA-Pro  86.67 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000100673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0034  tRNA-Pro  86.67 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.870471  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0053  tRNA-Pro  85.9 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000194568  unclonable  8.89969e-24 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0067  tRNA-Pro  91.11 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.588797  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0045  tRNA-Pro  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000186753  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t42  tRNA-Pro  89.29 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000750468  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0042  tRNA-Pro  87.3 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0047  tRNA-Pro  85.33 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0067  tRNA-Pro  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.912761 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0044  tRNA-Pro  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.408268  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1518  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000134274  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2512  tRNA-Pro  86.15 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.899251  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60200  tRNA-Pro  86.15 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000540929  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t33  tRNA-Pro  86.15 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152613  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0051  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000201389  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0046  tRNA-OTHER  87.76 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.165428  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA40  tRNA-Pro  86.15 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.82087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R40  tRNA-Pro  86.15 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.681358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28740  tRNA-Pro  86.15 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230263  hitchhiker  0.00000000587474 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0060  tRNA-Pro  88.46 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.108577  normal  0.0545385 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0493619  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt38  tRNA-Pro  88.24 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt38  tRNA-Pro  88.24 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0035  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000101815  hitchhiker  0.00514496 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0015  tRNA-Pro  84 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0316324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0051  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729144 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0033  tRNA-Pro  84 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00710383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0046  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0016  tRNA-Pro  84 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0040  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000750731  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0036  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000605853  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0054  tRNA-Pro  83.78 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0049  tRNA-Pro  86.96 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0011  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.908816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>