66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_R0026 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_R0026  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000262192  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0033  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 78 bp  131  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0033  tRNA-Pro  94.87 
 
 		 78 bp  123  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0055  tRNA-Pro  94.87 
 
 		 78 bp  123  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000146939  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0045  tRNA-Pro  92.31 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000186753  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0077  tRNA-Pro  91.03 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.98508e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0029  tRNA-Pro  88.46 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0046  tRNA-OTHER  93.88 
 
 		 71 bp  73.8  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.165428  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0031  tRNA-Pro  87.34 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0045  tRNA-Pro  88.33 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0890762  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0056  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0018  tRNA-Pro  87.72 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0047  tRNA-Pro  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0042  tRNA-Pro  83.33 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.465816  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0047  tRNA-Pro  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0062  tRNA-Pro  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000001951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0063  tRNA-Pro  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0013  tRNA-Pro  83.33 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.293207  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0039  tRNA-Pro  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0048  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.793007 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0057  tRNA-Pro  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434776 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0043  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0225474  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0065  tRNA-Pro  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.226717 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0062  tRNA-Pro  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.768136  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0032  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0041  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000127927 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0072  tRNA-Pro  96.43 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000117208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0092  tRNA-Pro  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0010  tRNA-Pro  86.44 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0034  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000221471  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0051  tRNA-Pro  83.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000728267 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Pro-5  tRNA-Pro  83.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110378  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0022  tRNA-Pro  83.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000000810765  normal  0.522992 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0048  tRNA-Pro  83.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0424708  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3525  tRNA-Pro  83.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.824024  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0027  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 71 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0065  tRNA-Pro  83.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0071534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0042  tRNA-Pro  83.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0325324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0049  tRNA-Pro  83.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00324423  hitchhiker  0.00377548 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0040  tRNA-Pro  83.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.438768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna13  tRNA-Pro  83.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0109171  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0038  tRNA-Pro  83.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0004  tRNA-Pro  83.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS00236  tRNA-Pro  83.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000448409  normal  0.197612 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0031  tRNA-Pro  83.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0236365 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0049  tRNA-Pro  83.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.27479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0080  tRNA-Pro  83.78 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0005  tRNA-Pro  83.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494404  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0022  tRNA-Pro  83.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000372763  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0021  tRNA-Pro  83.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000673649  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0050  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0047  tRNA-Pro  83.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0004  tRNA-Pro  83.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.640257 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0448  tRNA-Pro  83.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0052  tRNA-Pro  83.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0227827 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0022  tRNA-Pro  83.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000997774  normal  0.0266859 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1307  tRNA-Pro  83.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.724115  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3492  tRNA-Pro  83.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3528  tRNA-Pro  83.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.561103  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3256  tRNA-Pro  83.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0069  tRNA-Pro  83.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0515498  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0005  tRNA-Pro  83.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.3872  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t47  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.704703  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0087  tRNA-Pro  83.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13531  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0064  tRNA-Pro  83.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000117947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1138  tRNA-Pro  83.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>