12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_R0056 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_R0056  tRNA-Pro  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0045  tRNA-Pro  88.37 
 
 		 77 bp  99.6  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000186753  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0046  tRNA-OTHER  97.67 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.165428  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0033  tRNA-Pro  95.35 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0055  tRNA-Pro  95.56 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000146939  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0033  tRNA-Pro  95.56 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0077  tRNA-Pro  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.98508e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0026  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000262192  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0031  tRNA-Pro  92.68 
 
 		 79 bp  50.1  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0068  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.147043  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0058  tRNA-Phe  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.177326 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0045  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0890762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>