13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_R0058 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_R0058  tRNA-Phe  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.177326 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0057  tRNA-Phe  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.185879 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0017  tRNA-Phe  95.71 
 
 
74 bp  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0046  tRNA-Phe  96.72 
 
 
74 bp  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0016  tRNA-Phe  95.74 
 
 
73 bp  77.8  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0035  tRNA-Phe  90.48 
 
 
73 bp  69.9  0.00000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0011  tRNA-Phe  88.14 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.536334 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0028  tRNA-Phe  86.44 
 
 
74 bp  54  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0730899  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0010  tRNA-Phe  86.44 
 
 
74 bp  54  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0037  tRNA-Phe  86.44 
 
 
74 bp  54  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264586  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0006  tRNA-Phe  85.45 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.000148153 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0045  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000186753  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0056  tRNA-Pro  100 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>