68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_R0032 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_R0032  tRNA-Pro  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0138154  hitchhiker  0.00000207581 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0068  tRNA-Pro  90.41 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.147043  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0010  tRNA-Pro  94 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0571351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0024  tRNA-Pro  92.59 
 
 		 78 bp  75.8  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0023  tRNA-Pro  92.59 
 
 		 78 bp  75.8  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0043  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.417054  normal  0.645592 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0034  tRNA-Pro  97.44 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000537169  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0034  tRNA-Pro  92 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000221471  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0043  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.411383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0008  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152664  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0027  tRNA-Pro  94.87 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000011857  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0001  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0090  tRNA-Pro  91.3 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0096  tRNA-Pro  91.3 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0048  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0081  tRNA-Pro  91.3 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0023  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  0.736236 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0009  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.565399  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0009  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.687606  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0009  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0008  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0035  tRNA-Pro  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0035  tRNA-Pro  96.77 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000012695  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0031  tRNA-Pro  96.77 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000153307  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0031  tRNA-Pro  96.77 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000674228  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0035  tRNA-Pro  96.77 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124879  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0023  tRNA-Pro  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0030  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135671  decreased coverage  0.0000000375958 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0072  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000117208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0016  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0027  tRNA-Pro  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527994  normal  0.0630619 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0042  tRNA-Pro  96.67 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000616467  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.043428  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0022  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000263342  normal  0.454307 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0001  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000567837 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0054  tRNA-Pro  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13260  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0382436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0013  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.293207  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00070  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000758823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28350  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.145936 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0059  tRNA-Pro  85.07 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0058  tRNA-Pro  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210923  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0054  tRNA-Pro  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0007  tRNA-Pro  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0031  tRNA-Pro  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0031  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0044  tRNA-Pro  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00846239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0040  tRNA-Pro  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.123101  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0048  tRNA-Pro  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0007  tRNA-Pro  83.78 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.929508 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0012  tRNA-Pro  83.78 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04840  tRNA-Pro  83.78 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.51586 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0010  tRNA-Pro  83.78 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0057  tRNA-Pro  83.78 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0027  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26300  tRNA-Pro  83.78 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25920  tRNA-Pro  83.78 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0008  tRNA-Pro  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.802652  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0035  tRNA-Pro  83.78 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09860  tRNA-Pro  83.78 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.513474  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0010  tRNA-Pro  83.78 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60110  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0094  tRNA-Pro  83.78 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0049  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0019  tRNA-Pro  85.19 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.461088  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2126  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24870  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt29  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>