77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_R0048 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_R0048  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0031  tRNA-Pro  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000674228  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0031  tRNA-Pro  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000153307  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0007  tRNA-Pro  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0035  tRNA-Pro  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124879  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0048  tRNA-Pro  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0035  tRNA-Pro  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000012695  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0040  tRNA-Pro  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.123101  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0058  tRNA-Pro  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210923  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0050  tRNA-Pro  89.19 
 
 
73 bp  75.8  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0019  tRNA-Pro  87.18 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.461088  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0030  tRNA-Pro  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000233844  normal  0.0418304 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0001  tRNA-Pro  97.22 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0043  tRNA-Pro  97.22 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.411383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0008  tRNA-Pro  97.22 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152664  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0012  tRNA-Pro  85.92 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.762181  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0031  tRNA-Pro  100 
 
 
79 bp  60  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1378  tRNA-Pro  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0032  tRNA-Pro  86.49 
 
 
73 bp  60  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0138154  hitchhiker  0.00000207581 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2326  tRNA-Pro  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.261307  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0035  tRNA-Pro  96.97 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0042  tRNA-Pro  86.3 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000616467  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0036  tRNA-Pro  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0049  tRNA-Pro  96.97 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0031  tRNA-Pro  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.421646 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0011  tRNA-Pro  88.68 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12440  tRNA-Pro  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0011  tRNA-Pro  96.88 
 
 
77 bp  56  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.497936  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0012  tRNA-Pro  96.88 
 
 
77 bp  56  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0021  tRNA-Pro  94.29 
 
 
76 bp  54  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.979827  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0009  tRNA-Pro  83.78 
 
 
74 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.565399  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0008  tRNA-Pro  83.78 
 
 
74 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0014  tRNA-Pro  84.62 
 
 
78 bp  52  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0029  tRNA-Pro  87.93 
 
 
78 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0009  tRNA-Pro  83.78 
 
 
74 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.687606  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0055  tRNA-Pro  94.12 
 
 
78 bp  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000146939  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0009  tRNA-Pro  83.78 
 
 
74 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0004  tRNA-Pro  84.62 
 
 
78 bp  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0034  tRNA-Pro  83.12 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.155615  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0018  tRNA-Pro  86.79 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0023  tRNA-Pro  96.55 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  0.736236 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0021  tRNA-Pro  83.12 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0691598 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0028  tRNA-Pro  86.79 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0001  tRNA-Pro  86.79 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0012  tRNA-Pro  86.79 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.189557  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0020  tRNA-Pro  86.79 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.130246  normal  0.018662 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0036  tRNA-Pro  86.79 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2126  tRNA-Pro  83.56 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0032  tRNA-Pro  83.12 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025005  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0055  tRNA-Pro  85.96 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0018  tRNA-Pro  86.54 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.767214  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  93.75 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.043428  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0022  tRNA-Pro  93.75 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000263342  normal  0.454307 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0035  tRNA-Pro  87.5 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000197485  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0030  tRNA-Pro  85.71 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000324054  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt25  tRNA-Pro  84.75 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0015  tRNA-Pro  88.37 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.523292  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt25  tRNA-Pro  84.75 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0002  tRNA-Pro  86.27 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0054  tRNA-Pro  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0044  tRNA-Pro  91.43 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00846239  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0095  tRNA-Ile  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0010  tRNA-Pro  91.18 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0571351  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0023  tRNA-Pro  91.18 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0051  tRNA-Pro  86 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.659123  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0027  tRNA-Pro  91.18 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527994  normal  0.0630619 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0024  tRNA-Pro  94.12 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00967151  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0029  tRNA-Pro  91.18 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.264372  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0013  tRNA-Pro  91.18 
 
 
78 bp  44.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.293207  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00170  tRNA-Ile  100 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13260  tRNA-Pro  91.18 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0382436  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0054  tRNA-Pro  91.18 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24870  tRNA-Pro  82.86 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0031  tRNA-Pro  91.18 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0042  tRNA-Pro  89.13 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.164051  normal  0.792068 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60110  tRNA-Pro  82.86 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>