31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0899 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0899  Bleomycin hydrolase  100 
 
 
452 aa  938    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.326798 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0140  Bleomycin hydrolase  57.11 
 
 
442 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1760  aminopeptidase C  47.55 
 
 
445 aa  417  9.999999999999999e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0276  cysteine aminopeptidase C  45.86 
 
 
445 aa  414  1e-114  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0297  aminopeptidase C  46.3 
 
 
444 aa  414  1e-114  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2073  aminopeptidase C  45.96 
 
 
436 aa  395  1e-109  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0297  Bleomycin hydrolase  46.76 
 
 
446 aa  396  1e-109  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0461  aminopeptidase C  45.43 
 
 
446 aa  394  1e-108  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1289  Bleomycin hydrolase  47.11 
 
 
435 aa  394  1e-108  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0334  aminopeptidase C  43.53 
 
 
449 aa  381  1e-104  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.152514  hitchhiker  0.0000000000259652 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1255  peptidase C1-like protein  40.46 
 
 
480 aa  348  1e-94  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000154522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3912  Bleomycin hydrolase  40.9 
 
 
442 aa  336  3.9999999999999995e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0900  Bleomycin hydrolase  37.85 
 
 
489 aa  319  7e-86  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.717054  normal  0.208774 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0179  cysteine aminopeptidase  37 
 
 
445 aa  317  4e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000301553 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0181  cysteine aminopeptidase  40.45 
 
 
436 aa  316  5e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000920925 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0024  cysteine aminopeptidase  35.91 
 
 
438 aa  308  1.0000000000000001e-82  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58854  predicted protein  42.13 
 
 
502 aa  302  8.000000000000001e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0730  cysteine aminopeptidase  39.78 
 
 
440 aa  299  6e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000445184  normal  0.143132 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf878  aminopeptidase C  36.71 
 
 
442 aa  297  3e-79  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1881  Bleomycin hydrolase  35.27 
 
 
440 aa  295  1e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06399  conserved hypothetical protein  40.69 
 
 
518 aa  289  6e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.195522  normal  0.0430541 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0217  peptidase C1-like protein  36.64 
 
 
444 aa  287  2e-76  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1605  aminopeptidase C  36.9 
 
 
447 aa  287  2e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.845394 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1079  aminopeptidase C  36.92 
 
 
447 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1534  aminopeptidase C  50 
 
 
508 aa  218  2e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10538  hypothetical protein  25.19 
 
 
370 aa  60.5  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0682612  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6206  peptidase C1B bleomycin hydrolase  23.14 
 
 
376 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0714  peptidase C1B bleomycin hydrolase  21.76 
 
 
378 aa  53.9  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.563952  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1788  cysteine peptidase, putative  22.5 
 
 
423 aa  49.3  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1152  peptidase C1B, bleomycin hydrolase  22.29 
 
 
398 aa  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1729  peptidase C1B bleomycin hydrolase  20.14 
 
 
392 aa  46.2  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>