28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0179 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0179  cysteine aminopeptidase  100 
 
 
445 aa  926    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000301553 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0181  cysteine aminopeptidase  58.35 
 
 
436 aa  542  1e-153  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000920925 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0730  cysteine aminopeptidase  52.53 
 
 
440 aa  466  9.999999999999999e-131  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000445184  normal  0.143132 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0024  cysteine aminopeptidase  48.28 
 
 
438 aa  452  1.0000000000000001e-126  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0334  aminopeptidase C  46.95 
 
 
449 aa  420  1e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.152514  hitchhiker  0.0000000000259652 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1881  Bleomycin hydrolase  44.6 
 
 
440 aa  418  9.999999999999999e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1760  aminopeptidase C  43.47 
 
 
445 aa  388  1e-106  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0461  aminopeptidase C  43.54 
 
 
446 aa  383  1e-105  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0297  Bleomycin hydrolase  41.76 
 
 
446 aa  383  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0276  cysteine aminopeptidase C  41.42 
 
 
445 aa  359  6e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0297  aminopeptidase C  41.31 
 
 
444 aa  356  3.9999999999999996e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1289  Bleomycin hydrolase  39.54 
 
 
435 aa  352  8.999999999999999e-96  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0140  Bleomycin hydrolase  38.71 
 
 
442 aa  339  7e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2073  aminopeptidase C  40.27 
 
 
436 aa  335  7e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3912  Bleomycin hydrolase  35.39 
 
 
442 aa  323  5e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1605  aminopeptidase C  36.05 
 
 
447 aa  320  3.9999999999999996e-86  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.845394 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0899  Bleomycin hydrolase  37 
 
 
452 aa  317  4e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.326798 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06399  conserved hypothetical protein  36.69 
 
 
518 aa  313  3.9999999999999997e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.195522  normal  0.0430541 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58854  predicted protein  38.86 
 
 
502 aa  305  1.0000000000000001e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf878  aminopeptidase C  36.18 
 
 
442 aa  298  9e-80  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1534  aminopeptidase C  33.82 
 
 
508 aa  296  4e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1255  peptidase C1-like protein  33.48 
 
 
480 aa  285  8e-76  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000154522 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1079  aminopeptidase C  36.28 
 
 
447 aa  279  9e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0217  peptidase C1-like protein  35.91 
 
 
444 aa  278  1e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0900  Bleomycin hydrolase  32.06 
 
 
489 aa  252  7e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.717054  normal  0.208774 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10538  hypothetical protein  23 
 
 
370 aa  59.7  0.00000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0682612  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0714  peptidase C1B bleomycin hydrolase  21.49 
 
 
378 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.563952  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1788  cysteine peptidase, putative  19.32 
 
 
423 aa  49.3  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>