31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0334 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0334  aminopeptidase C  100 
 
 
449 aa  924    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.152514  hitchhiker  0.0000000000259652 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0297  Bleomycin hydrolase  55.01 
 
 
446 aa  513  1e-144  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1760  aminopeptidase C  54.46 
 
 
445 aa  509  1e-143  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0276  cysteine aminopeptidase C  51.23 
 
 
445 aa  476  1e-133  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0461  aminopeptidase C  51.23 
 
 
446 aa  474  1e-132  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1289  Bleomycin hydrolase  51.27 
 
 
435 aa  462  1e-129  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0297  aminopeptidase C  49.66 
 
 
444 aa  463  1e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0024  cysteine aminopeptidase  47.86 
 
 
438 aa  450  1e-125  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0140  Bleomycin hydrolase  48.42 
 
 
442 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2073  aminopeptidase C  48.42 
 
 
436 aa  434  1e-120  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0181  cysteine aminopeptidase  47.18 
 
 
436 aa  426  1e-118  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000920925 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0179  cysteine aminopeptidase  46.95 
 
 
445 aa  420  1e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000301553 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1881  Bleomycin hydrolase  44.65 
 
 
440 aa  410  1e-113  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0730  cysteine aminopeptidase  47 
 
 
440 aa  402  1e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000445184  normal  0.143132 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0899  Bleomycin hydrolase  43.53 
 
 
452 aa  381  1e-104  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.326798 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3912  Bleomycin hydrolase  36.77 
 
 
442 aa  343  2.9999999999999997e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1534  aminopeptidase C  35.6 
 
 
508 aa  335  1e-90  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58854  predicted protein  39.47 
 
 
502 aa  331  2e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1255  peptidase C1-like protein  36.61 
 
 
480 aa  323  3e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000154522 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0217  peptidase C1-like protein  37.95 
 
 
444 aa  320  3e-86  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1079  aminopeptidase C  37.72 
 
 
447 aa  318  1e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf878  aminopeptidase C  38.44 
 
 
442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06399  conserved hypothetical protein  38.12 
 
 
518 aa  308  1.0000000000000001e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.195522  normal  0.0430541 
 
 
-
 
NC_002950  PG1605  aminopeptidase C  32.13 
 
 
447 aa  288  1e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.845394 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0900  Bleomycin hydrolase  33.12 
 
 
489 aa  275  1.0000000000000001e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.717054  normal  0.208774 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0714  peptidase C1B bleomycin hydrolase  20.98 
 
 
378 aa  56.6  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.563952  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1788  cysteine peptidase, putative  19.95 
 
 
423 aa  55.1  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1152  peptidase C1B, bleomycin hydrolase  22.62 
 
 
398 aa  53.9  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3630  peptidase C1B bleomycin hydrolase  23.21 
 
 
394 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1729  peptidase C1B bleomycin hydrolase  21.69 
 
 
392 aa  50.4  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10538  hypothetical protein  23.28 
 
 
370 aa  48.5  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0682612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>