30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0217 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0217  peptidase C1-like protein  100 
 
 		 444 aa  923    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1079  aminopeptidase C  86.61 
 
 		 447 aa  803    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3912  Bleomycin hydrolase  41.37 
 
 		 442 aa  358  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0140  Bleomycin hydrolase  39.41 
 
 		 442 aa  328  9e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0334  aminopeptidase C  37.95 
 
 		 449 aa  320  3e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.152514  hitchhiker  0.0000000000259652 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0461  aminopeptidase C  38.77 
 
 		 446 aa  312  5.999999999999999e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1289  Bleomycin hydrolase  37.44 
 
 		 435 aa  308  9e-83  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1760  aminopeptidase C  36.44 
 
 		 445 aa  300  2e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0297  Bleomycin hydrolase  34.3 
 
 		 446 aa  290  3e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0899  Bleomycin hydrolase  36.64 
 
 		 452 aa  287  2e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.326798 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0024  cysteine aminopeptidase  35.96 
 
 		 438 aa  284  2.0000000000000002e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0297  aminopeptidase C  34.58 
 
 		 444 aa  279  5e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0179  cysteine aminopeptidase  35.91 
 
 		 445 aa  278  1e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000301553 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0181  cysteine aminopeptidase  36.28 
 
 		 436 aa  277  2e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000920925 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0276  cysteine aminopeptidase C  33.93 
 
 		 445 aa  276  5e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06399  conserved hypothetical protein  35.59 
 
 		 518 aa  273  4.0000000000000004e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.195522  normal  0.0430541 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1881  Bleomycin hydrolase  33.7 
 
 		 440 aa  267  2e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2073  aminopeptidase C  34.75 
 
 		 436 aa  268  2e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0730  cysteine aminopeptidase  35.65 
 
 		 440 aa  263  3e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000445184  normal  0.143132 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0900  Bleomycin hydrolase  34.05 
 
 		 489 aa  262  1e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.717054  normal  0.208774 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf878  aminopeptidase C  34.63 
 
 		 442 aa  260  4e-68  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58854  predicted protein  33.48 
 
 		 502 aa  253  3e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1534  aminopeptidase C  31.8 
 
 		 508 aa  249  9e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1255  peptidase C1-like protein  32.57 
 
 		 480 aa  243  6e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000154522 
 
 
-
 
NC_002950  PG1605  aminopeptidase C  31.76 
 
 		 447 aa  236  4e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.845394 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1729  peptidase C1B bleomycin hydrolase  23.43 
 
 		 392 aa  54.7  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3630  peptidase C1B bleomycin hydrolase  24.65 
 
 		 394 aa  54.7  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1152  peptidase C1B, bleomycin hydrolase  22.31 
 
 		 398 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0714  peptidase C1B bleomycin hydrolase  22.25 
 
 		 378 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.563952  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10538  hypothetical protein  22.02 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0682612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>