27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1255 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1255  peptidase C1-like protein  100 
 
 
480 aa  999    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000154522 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1534  aminopeptidase C  65.28 
 
 
508 aa  683    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0140  Bleomycin hydrolase  42.4 
 
 
442 aa  402  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0899  Bleomycin hydrolase  40.46 
 
 
452 aa  366  1e-100  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.326798 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0334  aminopeptidase C  37.24 
 
 
449 aa  339  8e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.152514  hitchhiker  0.0000000000259652 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0276  cysteine aminopeptidase C  37.53 
 
 
445 aa  324  3e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1289  Bleomycin hydrolase  37.12 
 
 
435 aa  320  3e-86  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2073  aminopeptidase C  36.25 
 
 
436 aa  316  5e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0900  Bleomycin hydrolase  37.08 
 
 
489 aa  314  1.9999999999999998e-84  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.717054  normal  0.208774 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0297  Bleomycin hydrolase  35.65 
 
 
446 aa  314  2.9999999999999996e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0024  cysteine aminopeptidase  36.25 
 
 
438 aa  311  2e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0297  aminopeptidase C  36.18 
 
 
444 aa  311  2e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1881  Bleomycin hydrolase  35.67 
 
 
440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf878  aminopeptidase C  35.52 
 
 
442 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0461  aminopeptidase C  36.23 
 
 
446 aa  305  2.0000000000000002e-81  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1760  aminopeptidase C  33.83 
 
 
445 aa  301  2e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0179  cysteine aminopeptidase  34.33 
 
 
445 aa  297  3e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000301553 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0730  cysteine aminopeptidase  36.25 
 
 
440 aa  291  2e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000445184  normal  0.143132 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0181  cysteine aminopeptidase  34.33 
 
 
436 aa  285  1.0000000000000001e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000920925 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3912  Bleomycin hydrolase  33.97 
 
 
442 aa  281  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06399  conserved hypothetical protein  32.99 
 
 
518 aa  271  2e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.195522  normal  0.0430541 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1079  aminopeptidase C  32.43 
 
 
447 aa  256  7e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0217  peptidase C1-like protein  32.57 
 
 
444 aa  254  3e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58854  predicted protein  35.86 
 
 
502 aa  248  1e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1605  aminopeptidase C  29.35 
 
 
447 aa  241  1e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.845394 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1729  peptidase C1B bleomycin hydrolase  21.08 
 
 
392 aa  51.6  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  25.6 
 
 
1242 aa  45.8  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>