29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0900 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0900  Bleomycin hydrolase  100 
 
 		 489 aa  1021    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.717054  normal  0.208774 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0899  Bleomycin hydrolase  37.85 
 
 		 452 aa  319  7.999999999999999e-86  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.326798 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0140  Bleomycin hydrolase  35.85 
 
 		 442 aa  318  2e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1534  aminopeptidase C  36.96 
 
 		 508 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1255  peptidase C1-like protein  37.26 
 
 		 480 aa  299  9e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000154522 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0334  aminopeptidase C  33.12 
 
 		 449 aa  275  1.0000000000000001e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.152514  hitchhiker  0.0000000000259652 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0730  cysteine aminopeptidase  36.63 
 
 		 440 aa  266  5e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000445184  normal  0.143132 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1760  aminopeptidase C  30.56 
 
 		 445 aa  266  8.999999999999999e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0217  peptidase C1-like protein  34.05 
 
 		 444 aa  262  1e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3912  Bleomycin hydrolase  33.98 
 
 		 442 aa  255  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1289  Bleomycin hydrolase  32.72 
 
 		 435 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1079  aminopeptidase C  32.55 
 
 		 447 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf878  aminopeptidase C  33.62 
 
 		 442 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0179  cysteine aminopeptidase  32.06 
 
 		 445 aa  252  8.000000000000001e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000301553 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0276  cysteine aminopeptidase C  33.89 
 
 		 445 aa  251  2e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0181  cysteine aminopeptidase  33.91 
 
 		 436 aa  251  2e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000920925 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0297  Bleomycin hydrolase  32.24 
 
 		 446 aa  251  2e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0297  aminopeptidase C  31.5 
 
 		 444 aa  246  6e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2073  aminopeptidase C  30.88 
 
 		 436 aa  243  5e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0461  aminopeptidase C  32.39 
 
 		 446 aa  243  7e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1881  Bleomycin hydrolase  30.74 
 
 		 440 aa  243  7.999999999999999e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1605  aminopeptidase C  30.6 
 
 		 447 aa  238  3e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.845394 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0024  cysteine aminopeptidase  31.77 
 
 		 438 aa  231  2e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06399  conserved hypothetical protein  30.44 
 
 		 518 aa  216  8e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.195522  normal  0.0430541 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58854  predicted protein  29.61 
 
 		 502 aa  209  1e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10538  hypothetical protein  22.59 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0682612  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3630  peptidase C1B bleomycin hydrolase  22.41 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1152  peptidase C1B, bleomycin hydrolase  21.39 
 
 		 398 aa  56.6  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1729  peptidase C1B bleomycin hydrolase  19.85 
 
 		 392 aa  47.8  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>