26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1788 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1788  cysteine peptidase, putative  100 
 
 
423 aa  886    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1152  peptidase C1B, bleomycin hydrolase  42.89 
 
 
398 aa  334  2e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0714  peptidase C1B bleomycin hydrolase  43.78 
 
 
378 aa  321  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.563952  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1729  peptidase C1B bleomycin hydrolase  39.6 
 
 
392 aa  302  8.000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3630  peptidase C1B bleomycin hydrolase  39.95 
 
 
394 aa  291  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10538  hypothetical protein  38.3 
 
 
370 aa  269  8e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0682612  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6206  peptidase C1B bleomycin hydrolase  35.75 
 
 
376 aa  262  8.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0276  cysteine aminopeptidase C  23.59 
 
 
445 aa  70.1  0.00000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1289  Bleomycin hydrolase  24.31 
 
 
435 aa  69.3  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0181  cysteine aminopeptidase  24.88 
 
 
436 aa  66.6  0.0000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000920925 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0140  Bleomycin hydrolase  25.12 
 
 
442 aa  65.1  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0730  cysteine aminopeptidase  24.04 
 
 
440 aa  63.5  0.000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000445184  normal  0.143132 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0297  aminopeptidase C  22.22 
 
 
444 aa  60.5  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0297  Bleomycin hydrolase  21.2 
 
 
446 aa  55.1  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0334  aminopeptidase C  19.95 
 
 
449 aa  55.1  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.152514  hitchhiker  0.0000000000259652 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0461  aminopeptidase C  22.43 
 
 
446 aa  54.7  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1605  aminopeptidase C  22.98 
 
 
447 aa  54.3  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.845394 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf878  aminopeptidase C  20.1 
 
 
442 aa  52  0.00002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1881  Bleomycin hydrolase  24.42 
 
 
440 aa  50.1  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0899  Bleomycin hydrolase  22.5 
 
 
452 aa  49.3  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.326798 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0179  cysteine aminopeptidase  19.32 
 
 
445 aa  49.3  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000301553 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1760  aminopeptidase C  22.28 
 
 
445 aa  48.5  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  33.8 
 
 
1202 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3912  Bleomycin hydrolase  18.75 
 
 
442 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  46.15 
 
 
812 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2073  aminopeptidase C  20.98 
 
 
436 aa  43.1  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>