22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6206 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6206  peptidase C1B bleomycin hydrolase  100 
 
 
376 aa  786    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10538  hypothetical protein  41.8 
 
 
370 aa  289  4e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0682612  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0714  peptidase C1B bleomycin hydrolase  40.21 
 
 
378 aa  278  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.563952  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1152  peptidase C1B, bleomycin hydrolase  37.1 
 
 
398 aa  264  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1788  cysteine peptidase, putative  35.75 
 
 
423 aa  262  6.999999999999999e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1729  peptidase C1B bleomycin hydrolase  37.09 
 
 
392 aa  245  9.999999999999999e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3630  peptidase C1B bleomycin hydrolase  36.42 
 
 
394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0140  Bleomycin hydrolase  24.2 
 
 
442 aa  70.5  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0899  Bleomycin hydrolase  23.14 
 
 
452 aa  57.8  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.326798 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1289  Bleomycin hydrolase  22.08 
 
 
435 aa  55.1  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3912  Bleomycin hydrolase  20.61 
 
 
442 aa  53.5  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0297  aminopeptidase C  23.64 
 
 
444 aa  53.5  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1605  aminopeptidase C  26.05 
 
 
447 aa  50.4  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.845394 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2073  aminopeptidase C  23.28 
 
 
436 aa  50.1  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1881  Bleomycin hydrolase  21.72 
 
 
440 aa  48.5  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0461  aminopeptidase C  22.77 
 
 
446 aa  47.8  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0297  Bleomycin hydrolase  21.3 
 
 
446 aa  48.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf878  aminopeptidase C  23.1 
 
 
442 aa  45.4  0.002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0024  cysteine aminopeptidase  25.39 
 
 
438 aa  45.1  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0276  cysteine aminopeptidase C  22.06 
 
 
445 aa  45.4  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1760  aminopeptidase C  20.94 
 
 
445 aa  45.1  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0206  peptidase C1A papain  40.43 
 
 
797 aa  44.3  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>