13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0206 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0206  peptidase C1A papain  100 
 
 
797 aa  1635    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0124  hypothetical protein  73.47 
 
 
737 aa  301  3e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.712777 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  28.05 
 
 
1565 aa  62  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  23.88 
 
 
1096 aa  59.7  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4005  peptidase C1A, papain  25.27 
 
 
619 aa  58.2  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0983  peptidase C1A papain  24.26 
 
 
305 aa  52  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1013  PKD domain-containing protein  31.01 
 
 
842 aa  52.4  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000167268  normal  0.298358 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  47.62 
 
 
1202 aa  45.4  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0734  cysteine protease  22.43 
 
 
323 aa  45.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  43.48 
 
 
812 aa  44.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3972  PKD domain-containing protein  29.2 
 
 
993 aa  44.7  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0213  peptidase C1A papain  42.55 
 
 
814 aa  44.3  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.590308 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6206  peptidase C1B bleomycin hydrolase  40.43 
 
 
376 aa  44.3  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>