39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_2978 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_2978  tripartite ATP-independent periplasmic transporter, DctQ component  100 
 
 		 148 aa  296  9e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3083  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  98.65 
 
 		 224 aa  295  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502464  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2891  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  93.92 
 
 		 222 aa  263  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2923  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  73.13 
 
 		 210 aa  189  9e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.640281 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4220  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  66.14 
 
 		 207 aa  187  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0174615 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2479  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  68.38 
 
 		 206 aa  167  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.447781  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3132  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  68.38 
 
 		 206 aa  167  7e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4052  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  59.23 
 
 		 206 aa  163  8e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.654471  normal  0.207214 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3364  hypothetical protein  63.64 
 
 		 206 aa  156  9e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.306175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1940  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  49.31 
 
 		 222 aa  138  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80655 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4951  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  54.9 
 
 		 222 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3371  TRAP-T family transporter small inner membrane subunit  46.3 
 
 		 190 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123148  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3017  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  46.3 
 
 		 190 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0345  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  41.8 
 
 		 204 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57383  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3868  hypothetical protein  46.08 
 
 		 190 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0453  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  33.91 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0983838  normal  0.382149 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1242  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  35.56 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000810509  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1735  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  36.78 
 
 		 204 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0099  TRAP dicarboxylate family transporter DctQ subunit  36.78 
 
 		 204 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0669056  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1688  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  37.08 
 
 		 199 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2649  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  30.69 
 
 		 184 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.531292  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3474  putative TRAP C4-dicarboxylate transport system, DctQ subunit (small permease component)  33.33 
 
 		 179 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3061  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  28.16 
 
 		 186 aa  47.4  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.287187  hitchhiker  0.000081525 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1711  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  34.88 
 
 		 191 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0725939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4765  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.21 
 
 		 212 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010311 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4834  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  36.05 
 
 		 188 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.389567  normal  0.0357026 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0710  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  35.44 
 
 		 179 aa  43.9  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0086052  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2006  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  34.25 
 
 		 192 aa  43.9  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.404305  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1476  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.23 
 
 		 179 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.661481  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1218  tripartite ATP-independent periplasmic transporter, DctQ component  31.03 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2871  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  33.72 
 
 		 202 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0426  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  32.56 
 
 		 175 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.196909  normal  0.0233396 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2752  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.55 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.328918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1565  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.74 
 
 		 207 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.124017  normal  0.0201638 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0694  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.55 
 
 		 180 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617853  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0654  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.55 
 
 		 183 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.197985  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0392  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  34.62 
 
 		 190 aa  40.4  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000784844  hitchhiker  0.00380366 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1814  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.91 
 
 		 185 aa  40.4  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2072  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.26 
 
 		 198 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.490973 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>