22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1029 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1029  UspA domain-containing protein  100 
 
 
293 aa  563  1e-160  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3048  UspA domain-containing protein  46.76 
 
 
289 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  28.26 
 
 
150 aa  51.2  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  25 
 
 
147 aa  50.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  26.67 
 
 
150 aa  48.5  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  27.14 
 
 
151 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  25.9 
 
 
149 aa  47.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  25.18 
 
 
149 aa  47  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  24.39 
 
 
147 aa  47  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  32.26 
 
 
148 aa  46.2  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  27.61 
 
 
151 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2057  UspA domain protein  28.79 
 
 
137 aa  45.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.612176  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  28.11 
 
 
305 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  27.75 
 
 
290 aa  45.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  25.81 
 
 
147 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  30.05 
 
 
304 aa  44.3  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  27.12 
 
 
300 aa  44.3  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  24.29 
 
 
151 aa  43.5  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  32.17 
 
 
159 aa  43.1  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1208  UspA domain-containing protein  26.56 
 
 
295 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.041465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  31.58 
 
 
149 aa  42.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  37.7 
 
 
156 aa  42.4  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>