141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1860 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1860  Formate--tetrahydrofolate ligase  100 
 
 		 557 aa  1140    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.458674  normal  0.41641 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0118  formate--tetrahydrofolate ligase  54.48 
 
 		 557 aa  576  1.0000000000000001e-163  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2399  formate-tetrahydrofolate ligase  52.06 
 
 		 556 aa  558  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0018  formate-tetrahydrofolate ligase FTHFS  51.73 
 
 		 556 aa  555  1e-157  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0109  formate--tetrahydrofolate ligase  52.15 
 
 		 559 aa  549  1e-155  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1593  formate--tetrahydrofolate ligase  50.76 
 
 		 583 aa  550  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211237  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0795  formate--tetrahydrofolate ligase  52.92 
 
 		 555 aa  551  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00613459  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2471  formate--tetrahydrofolate ligase  51.31 
 
 		 556 aa  545  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1712  formate--tetrahydrofolate ligase  52.71 
 
 		 558 aa  548  1e-154  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.311565 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2785  formate--tetrahydrofolate ligase  51.5 
 
 		 556 aa  543  1e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1317  formate--tetrahydrofolate ligase  52.43 
 
 		 555 aa  541  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1580  formate--tetrahydrofolate ligase  52.43 
 
 		 555 aa  541  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0203021 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0149  formate--tetrahydrofolate ligase  51.41 
 
 		 556 aa  543  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3185  Formate--tetrahydrofolate ligase  52.64 
 
 		 560 aa  541  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2105  Formate--tetrahydrofolate ligase  51.85 
 
 		 553 aa  543  1e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0816  Formate--tetrahydrofolate ligase  52.8 
 
 		 554 aa  542  1e-153  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0136585  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2125  Formate--tetrahydrofolate ligase  51.59 
 
 		 553 aa  539  9.999999999999999e-153  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1052  formate--tetrahydrofolate ligase  51.5 
 
 		 556 aa  540  9.999999999999999e-153  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0083  Formate-tetrahydrofolate ligase  51.66 
 
 		 556 aa  540  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.784091  normal  0.246286 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0555  formate--tetrahydrofolate ligase  51.85 
 
 		 558 aa  536  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2355  formate--tetrahydrofolate ligase  50.09 
 
 		 569 aa  536  1e-151  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1952  formate--tetrahydrofolate ligase  50.66 
 
 		 583 aa  537  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0316175  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3197  formate--tetrahydrofolate ligase  50.47 
 
 		 562 aa  533  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.780376  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2187  formate--tetrahydrofolate ligase  50.47 
 
 		 562 aa  533  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0200027  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1959  formate--tetrahydrofolate ligase  50.66 
 
 		 562 aa  533  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1938  formate--tetrahydrofolate ligase  50.66 
 
 		 562 aa  533  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1914  formate--tetrahydrofolate ligase  50.66 
 
 		 562 aa  533  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.251904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2107  formate--tetrahydrofolate ligase  50.66 
 
 		 562 aa  533  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2141  formate--tetrahydrofolate ligase  50.66 
 
 		 562 aa  533  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2815  formate--tetrahydrofolate ligase  51.87 
 
 		 559 aa  532  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.90071  normal  0.0134554 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2117  formate--tetrahydrofolate ligase  50.47 
 
 		 583 aa  534  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.546563  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2201  formate--tetrahydrofolate ligase  50.56 
 
 		 562 aa  533  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045703  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0451  Formate--tetrahydrofolate ligase  50.19 
 
 		 555 aa  531  1e-149  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3083  formate--tetrahydrofolate ligase  52.25 
 
 		 559 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2204  formate--tetrahydrofolate ligase  49.91 
 
 		 559 aa  526  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.160817  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0837  formate--tetrahydrofolate ligase  50.56 
 
 		 556 aa  526  1e-148  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.21789  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1787  formate--tetrahydrofolate ligase  49.63 
 
 		 555 aa  526  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1822  formate--tetrahydrofolate ligase  49.63 
 
 		 555 aa  526  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.173797  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1283  formate--tetrahydrofolate ligase  50.65 
 
 		 555 aa  525  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0499733  normal  0.578688 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2752  formate--tetrahydrofolate ligase  47.99 
 
 		 556 aa  525  1e-148  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00362383  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3272  formate--tetrahydrofolate ligase  50.65 
 
 		 555 aa  526  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1321  formate--tetrahydrofolate ligase  51.15 
 
 		 555 aa  523  1e-147  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1409  formate--tetrahydrofolate ligase  49.45 
 
 		 555 aa  524  1e-147  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000797787  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1007  formate--tetrahydrofolate ligase  50.75 
 
 		 555 aa  525  1e-147  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0866489  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3264  formate--tetrahydrofolate ligase  49.91 
 
 		 561 aa  523  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3236  formate--tetrahydrofolate ligase  51.38 
 
 		 558 aa  525  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.932652  normal  0.61785 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1654  formate--tetrahydrofolate ligase  53.07 
 
 		 555 aa  523  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0498666 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0447  Formate--tetrahydrofolate ligase  51.3 
 
 		 557 aa  520  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.391987 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1055  formate--tetrahydrofolate ligase  49.26 
 
 		 556 aa  521  1e-146  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1412  formate-tetrahydrofolate ligase  50.75 
 
 		 556 aa  519  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.749382  hitchhiker  0.00000422387 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1009  formate-tetrahydrofolate ligase  51.62 
 
 		 560 aa  518  1e-146  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.749229 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00600  Formate--tetrahydrofolate ligase  50.75 
 
 		 554 aa  521  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00136025  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2298  formate--tetrahydrofolate ligase  49.63 
 
 		 559 aa  519  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.307392 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2864  Formate--tetrahydrofolate ligase  53 
 
 		 555 aa  521  1e-146  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0414  formate--tetrahydrofolate ligase  51.49 
 
 		 557 aa  521  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119816  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1275  formate--tetrahydrofolate ligase  50.37 
 
 		 560 aa  521  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0019  formate--tetrahydrofolate ligase  50 
 
 		 554 aa  515  1.0000000000000001e-145  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000114952  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0663  formate--tetrahydrofolate ligase  50.84 
 
 		 557 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2316  formate--tetrahydrofolate ligase  50.84 
 
 		 557 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.345965 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0569  formate--tetrahydrofolate ligase  50.93 
 
 		 557 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0131  formate--tetrahydrofolate ligase  50.28 
 
 		 553 aa  518  1.0000000000000001e-145  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2219  formate--tetrahydrofolate ligase  49.63 
 
 		 557 aa  514  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.83616  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2358  formate--tetrahydrofolate ligase  50 
 
 		 558 aa  513  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.269795  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0621  Formate--tetrahydrofolate ligase  50.74 
 
 		 557 aa  513  1e-144  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.164812  normal  0.927809 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4459  formate-tetrahydrofolate ligase FTHFS  51.2 
 
 		 558 aa  511  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0477556  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0484  Formate--tetrahydrofolate ligase  50.74 
 
 		 557 aa  514  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1295  formate--tetrahydrofolate ligase  47.58 
 
 		 555 aa  509  1e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.973248  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0304  formate--tetrahydrofolate ligase  50.56 
 
 		 551 aa  510  1e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20990  Formate-tetrahydrofolate ligase  51.78 
 
 		 556 aa  509  1e-143  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4072  formate--tetrahydrofolate ligase  51.12 
 
 		 557 aa  509  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0981  formate--tetrahydrofolate ligase  49.81 
 
 		 558 aa  506  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.911463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2254  formate-tetrahydrofolate ligase  49.17 
 
 		 557 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000171666  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0701  formate-tetrahydrofolate ligase  50.28 
 
 		 554 aa  506  9.999999999999999e-143  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.287998  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1756  formate--tetrahydrofolate ligase  47.75 
 
 		 554 aa  507  9.999999999999999e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24910  Formate-tetrahydrofolate ligase  51.12 
 
 		 557 aa  502  1e-141  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2901  formate--tetrahydrofolate ligase  52.08 
 
 		 565 aa  500  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0358  formate--tetrahydrofolate ligase  50.37 
 
 		 550 aa  501  1e-140  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0792424  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1079  formate--tetrahydrofolate ligase  50.09 
 
 		 552 aa  501  1e-140  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000612809  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1383  formate--tetrahydrofolate ligase  50.64 
 
 		 565 aa  499  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1637  Formate--tetrahydrofolate ligase  48.06 
 
 		 544 aa  499  1e-140  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02250  Formate-tetrahydrofolate ligase  52.78 
 
 		 555 aa  498  1e-139  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1054  formate--tetrahydrofolate ligase  48.33 
 
 		 542 aa  495  9.999999999999999e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0129  formate--tetrahydrofolate ligase  48.09 
 
 		 567 aa  491  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000126752  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2767  formate--tetrahydrofolate ligase  50.47 
 
 		 557 aa  489  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0163716  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1058  formate--tetrahydrofolate ligase  48.14 
 
 		 542 aa  491  1e-137  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25140  Formate-tetrahydrofolate ligase  47.96 
 
 		 557 aa  491  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.350254  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0769  formate-tetrahydrofolate ligase  48.5 
 
 		 553 aa  485  1e-136  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.115435  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0269  Formate--tetrahydrofolate ligase  49.45 
 
 		 551 aa  486  1e-136  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2610  formate--tetrahydrofolate ligase  52.01 
 
 		 558 aa  483  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00320699 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1111  Formate--tetrahydrofolate ligase  47.27 
 
 		 551 aa  481  1e-134  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.596432  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0231  Formate--tetrahydrofolate ligase  46.96 
 
 		 567 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0089  formate--tetrahydrofolate ligase  46.1 
 
 		 566 aa  473  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.985231  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2208  Formate--tetrahydrofolate ligase  46.22 
 
 		 552 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000668109  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4561  formate-tetrahydrofolate ligase  49.54 
 
 		 559 aa  468  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2057  Formate--tetrahydrofolate ligase  45.92 
 
 		 567 aa  464  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0522  formate--tetrahydrofolate ligase  46.69 
 
 		 564 aa  459  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.897337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4339  formate--tetrahydrofolate ligase  44.66 
 
 		 570 aa  455  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0636  Formate--tetrahydrofolate ligase  46.01 
 
 		 536 aa  454  1.0000000000000001e-126  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0443  formate--tetrahydrofolate ligase  44.16 
 
 		 564 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.507159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0219  formate--tetrahydrofolate ligase  46.79 
 
 		 564 aa  453  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>