141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0019 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1321  formate--tetrahydrofolate ligase  66.49 
 
 
555 aa  759    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0019  formate--tetrahydrofolate ligase  100 
 
 
554 aa  1123    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000114952  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2125  Formate--tetrahydrofolate ligase  56.17 
 
 
553 aa  579  1e-164  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0795  formate--tetrahydrofolate ligase  54.68 
 
 
555 aa  579  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00613459  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0149  formate--tetrahydrofolate ligase  53.78 
 
 
556 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2752  formate--tetrahydrofolate ligase  54.58 
 
 
556 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00362383  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0109  formate--tetrahydrofolate ligase  53.79 
 
 
559 aa  571  1e-161  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1712  formate--tetrahydrofolate ligase  53.58 
 
 
558 aa  571  1e-161  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.311565 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1052  formate--tetrahydrofolate ligase  53.5 
 
 
556 aa  570  1e-161  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00600  Formate--tetrahydrofolate ligase  54.05 
 
 
554 aa  559  1e-158  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00136025  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0083  Formate-tetrahydrofolate ligase  52.52 
 
 
556 aa  559  1e-158  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.784091  normal  0.246286 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1409  formate--tetrahydrofolate ligase  50.9 
 
 
555 aa  556  1e-157  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000797787  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2298  formate--tetrahydrofolate ligase  52.52 
 
 
559 aa  555  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.307392 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1055  formate--tetrahydrofolate ligase  52.34 
 
 
556 aa  555  1e-156  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3264  formate--tetrahydrofolate ligase  51.96 
 
 
561 aa  553  1e-156  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0358  formate--tetrahydrofolate ligase  52.87 
 
 
550 aa  553  1e-156  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0792424  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2254  formate-tetrahydrofolate ligase  51.35 
 
 
557 aa  551  1e-155  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000171666  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1412  formate-tetrahydrofolate ligase  52.16 
 
 
556 aa  550  1e-155  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.749382  hitchhiker  0.00000422387 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1007  formate--tetrahydrofolate ligase  50.9 
 
 
555 aa  551  1e-155  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0866489  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0018  formate-tetrahydrofolate ligase FTHFS  51.92 
 
 
556 aa  550  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1009  formate-tetrahydrofolate ligase  53.6 
 
 
560 aa  551  1e-155  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.749229 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2399  formate-tetrahydrofolate ligase  52.7 
 
 
556 aa  550  1e-155  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2105  Formate--tetrahydrofolate ligase  54.5 
 
 
553 aa  550  1e-155  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1756  formate--tetrahydrofolate ligase  52.24 
 
 
554 aa  549  1e-155  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3236  formate--tetrahydrofolate ligase  51.53 
 
 
558 aa  550  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.932652  normal  0.61785 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0555  formate--tetrahydrofolate ligase  52.06 
 
 
558 aa  546  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2204  formate--tetrahydrofolate ligase  51.98 
 
 
559 aa  545  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.160817  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2785  formate--tetrahydrofolate ligase  51.62 
 
 
556 aa  546  1e-154  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2471  formate--tetrahydrofolate ligase  51.62 
 
 
556 aa  546  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2815  formate--tetrahydrofolate ligase  52.88 
 
 
559 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.90071  normal  0.0134554 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1317  formate--tetrahydrofolate ligase  50.63 
 
 
555 aa  543  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1580  formate--tetrahydrofolate ligase  50.63 
 
 
555 aa  543  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0203021 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4459  formate-tetrahydrofolate ligase FTHFS  51.89 
 
 
558 aa  545  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0477556  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2355  formate--tetrahydrofolate ligase  51.6 
 
 
569 aa  542  1e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1654  formate--tetrahydrofolate ligase  52.7 
 
 
555 aa  545  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0498666 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0837  formate--tetrahydrofolate ligase  51.44 
 
 
556 aa  538  9.999999999999999e-153  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.21789  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3083  formate--tetrahydrofolate ligase  53.24 
 
 
559 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1079  formate--tetrahydrofolate ligase  52.52 
 
 
552 aa  538  9.999999999999999e-153  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000612809  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0484  Formate--tetrahydrofolate ligase  51.16 
 
 
557 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1111  Formate--tetrahydrofolate ligase  51.63 
 
 
551 aa  535  1e-151  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.596432  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0447  Formate--tetrahydrofolate ligase  51.79 
 
 
557 aa  538  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.391987 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0304  formate--tetrahydrofolate ligase  52.06 
 
 
551 aa  536  1e-151  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1593  formate--tetrahydrofolate ligase  51 
 
 
583 aa  536  1e-151  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211237  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0414  formate--tetrahydrofolate ligase  51.79 
 
 
557 aa  538  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119816  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4072  formate--tetrahydrofolate ligase  50.9 
 
 
557 aa  534  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330783  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2187  formate--tetrahydrofolate ligase  51 
 
 
562 aa  530  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0200027  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1959  formate--tetrahydrofolate ligase  50.82 
 
 
562 aa  530  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1938  formate--tetrahydrofolate ligase  50.82 
 
 
562 aa  530  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1914  formate--tetrahydrofolate ligase  50.82 
 
 
562 aa  530  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.251904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2107  formate--tetrahydrofolate ligase  50.82 
 
 
562 aa  530  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2141  formate--tetrahydrofolate ligase  50.82 
 
 
562 aa  530  1e-149  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3185  Formate--tetrahydrofolate ligase  51.27 
 
 
560 aa  530  1e-149  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0451  Formate--tetrahydrofolate ligase  51.43 
 
 
555 aa  531  1e-149  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1952  formate--tetrahydrofolate ligase  50.82 
 
 
583 aa  531  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0316175  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1275  formate--tetrahydrofolate ligase  50.18 
 
 
560 aa  530  1e-149  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3197  formate--tetrahydrofolate ligase  51 
 
 
562 aa  530  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.780376  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2117  formate--tetrahydrofolate ligase  51 
 
 
583 aa  529  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.546563  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2219  formate--tetrahydrofolate ligase  51.07 
 
 
557 aa  525  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.83616  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3272  formate--tetrahydrofolate ligase  50.27 
 
 
555 aa  528  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24910  Formate-tetrahydrofolate ligase  51.62 
 
 
557 aa  526  1e-148  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2201  formate--tetrahydrofolate ligase  50.64 
 
 
562 aa  528  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045703  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0663  formate--tetrahydrofolate ligase  51.26 
 
 
557 aa  525  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2316  formate--tetrahydrofolate ligase  51.26 
 
 
557 aa  525  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.345965 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0118  formate--tetrahydrofolate ligase  48.83 
 
 
557 aa  523  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0816  Formate--tetrahydrofolate ligase  50.36 
 
 
554 aa  520  1e-146  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0136585  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2864  Formate--tetrahydrofolate ligase  50.72 
 
 
555 aa  520  1e-146  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1283  formate--tetrahydrofolate ligase  50 
 
 
555 aa  520  1e-146  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0499733  normal  0.578688 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1295  formate--tetrahydrofolate ligase  48.53 
 
 
555 aa  518  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.973248  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0981  formate--tetrahydrofolate ligase  50.63 
 
 
558 aa  516  1.0000000000000001e-145  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.911463  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0569  formate--tetrahydrofolate ligase  50.72 
 
 
557 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134606  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1787  formate--tetrahydrofolate ligase  49.28 
 
 
555 aa  517  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0131  formate--tetrahydrofolate ligase  49.46 
 
 
553 aa  516  1.0000000000000001e-145  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1822  formate--tetrahydrofolate ligase  49.28 
 
 
555 aa  517  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.173797  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20990  Formate-tetrahydrofolate ligase  50.27 
 
 
556 aa  516  1.0000000000000001e-145  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2358  formate--tetrahydrofolate ligase  50.99 
 
 
558 aa  512  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.269795  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0621  Formate--tetrahydrofolate ligase  48.74 
 
 
557 aa  513  1e-144  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.164812  normal  0.927809 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1383  formate--tetrahydrofolate ligase  49.82 
 
 
565 aa  513  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1860  Formate--tetrahydrofolate ligase  50 
 
 
557 aa  511  1e-143  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.458674  normal  0.41641 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0269  Formate--tetrahydrofolate ligase  50.8 
 
 
551 aa  505  9.999999999999999e-143  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4561  formate-tetrahydrofolate ligase  49.37 
 
 
559 aa  501  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1054  formate--tetrahydrofolate ligase  49.54 
 
 
542 aa  499  1e-140  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1058  formate--tetrahydrofolate ligase  49.36 
 
 
542 aa  497  1e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2901  formate--tetrahydrofolate ligase  50.91 
 
 
565 aa  494  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2767  formate--tetrahydrofolate ligase  48.11 
 
 
557 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0163716  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25140  Formate-tetrahydrofolate ligase  47.23 
 
 
557 aa  490  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.350254  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2610  formate--tetrahydrofolate ligase  49.1 
 
 
558 aa  483  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00320699 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2208  Formate--tetrahydrofolate ligase  46.1 
 
 
552 aa  483  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000668109  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1637  Formate--tetrahydrofolate ligase  47.16 
 
 
544 aa  484  1e-135  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02250  Formate-tetrahydrofolate ligase  49.1 
 
 
555 aa  481  1e-134  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0701  formate-tetrahydrofolate ligase  47.5 
 
 
554 aa  479  1e-134  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.287998  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0769  formate-tetrahydrofolate ligase  45.42 
 
 
553 aa  476  1e-133  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.115435  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12980  formate--tetrahydrofolate ligase  46.1 
 
 
564 aa  470  1.0000000000000001e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.700503 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0766  formate--tetrahydrofolate ligase  45.36 
 
 
576 aa  462  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1568  formate--tetrahydrofolate ligase  45.53 
 
 
576 aa  464  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110911  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2519  formate--tetrahydrofolate ligase  45.55 
 
 
573 aa  464  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1820  Formate--tetrahydrofolate ligase  44.97 
 
 
565 aa  459  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0231  Formate--tetrahydrofolate ligase  45.47 
 
 
567 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1016  formate--tetrahydrofolate ligase  46.07 
 
 
559 aa  456  1e-127  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000113596  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0129  formate--tetrahydrofolate ligase  45.8 
 
 
567 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000126752  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0636  Formate--tetrahydrofolate ligase  46.38 
 
 
536 aa  457  1e-127  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>