144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5672 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5672  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
372 aa  704    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.357223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6022  hypothetical protein  33.04 
 
 
344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0534003  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1986  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
345 aa  91.3  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.583564  normal  0.569103 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2207  GCN5-related N-acetyltransferase  39.51 
 
 
227 aa  84  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000126395  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1513  GCN5-related N-acetyltransferase  37.42 
 
 
208 aa  84  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000491208 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1423  CoA-binding domain-containing protein  34.1 
 
 
909 aa  82.8  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.382585  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27480  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  36.13 
 
 
926 aa  82.8  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 
868 aa  80.1  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277001  normal  0.28701 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1628  GCN5-related N-acetyltransferase  31.93 
 
 
901 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1469  CoA-binding domain protein  32.91 
 
 
902 aa  76.6  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1564  GCN5-related N-acetyltransferase  39.39 
 
 
208 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0937602  normal  0.632763 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1628  CoA-binding domain protein  35.03 
 
 
821 aa  75.1  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00866172  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15880  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  32.4 
 
 
831 aa  73.9  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00274098  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4769  amino acid-binding ACT domain protein  33.13 
 
 
355 aa  73.9  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3083  GCN5-related N-acetyltransferase  36.08 
 
 
192 aa  73.6  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.458832  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  28.57 
 
 
915 aa  72.8  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3564  CoA-binding domain protein  29.75 
 
 
902 aa  72.4  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.695831  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2948  CoA-binding domain-containing protein  30.97 
 
 
899 aa  71.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.574552  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3787  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 
893 aa  71.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.152255  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13180  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  29.52 
 
 
909 aa  70.1  0.00000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.135541  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1929  GCN5-related protein N-acetyltransferase  34.19 
 
 
907 aa  70.1  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.191743 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2384  CoA-binding domain-containing protein  32.28 
 
 
887 aa  69.3  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.272058 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2128  hypothetical protein  29.49 
 
 
907 aa  68.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505771  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1548  CoA-binding domain protein  33.33 
 
 
899 aa  68.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25767  normal  0.134976 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  29.73 
 
 
920 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  27.04 
 
 
918 aa  67.4  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14440  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  30.97 
 
 
908 aa  67.4  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.268462  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1293  GCN5-related N-acetyltransferase  35.26 
 
 
173 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2271  GCN5-related N-acetyltransferase  33.54 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3299  CoA-binding domain protein  28.3 
 
 
976 aa  66.6  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1622  CoA-binding domain protein  27.71 
 
 
894 aa  66.2  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000156668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  32.89 
 
 
883 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3502  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
872 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667038  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  29.88 
 
 
911 aa  65.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1694  GCN5-related N-acetyltransferase  31.35 
 
 
926 aa  65.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133796  normal  0.55865 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0051  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 
173 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1311  hypothetical protein  33.53 
 
 
886 aa  65.1  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2237  CoA-binding domain protein  33.77 
 
 
950 aa  65.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0315579  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  34.81 
 
 
926 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000141408  hitchhiker  0.0047804 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1833  CoA-binding domain protein  30.3 
 
 
903 aa  63.5  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.415665  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1772  GCN5-related N-acetyltransferase  30.36 
 
 
188 aa  63.5  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0639273  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7067  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  30.38 
 
 
881 aa  63.2  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1200  GCN5-related N-acetyltransferase  31.68 
 
 
867 aa  62.8  0.000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4706  ACT domain-containing protein  37.13 
 
 
253 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.113102  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3748  GCN5-related N-acetyltransferase  25.64 
 
 
882 aa  61.6  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0223555  normal  0.236384 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0837  GCN5-related N-acetyltransferase  19.75 
 
 
176 aa  61.6  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00901347  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4062  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.4 
 
 
281 aa  60.1  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0619  acetyl-CoA hydrolase/transferase  23.64 
 
 
627 aa  59.3  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  29.87 
 
 
892 aa  58.9  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3337  GCN5-related N-acetyltransferase  25.61 
 
 
882 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  25.85 
 
 
921 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4256  GCN5-related N-acetyltransferase  32.5 
 
 
173 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.330329  normal  0.825884 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0086  acetyl-CoA hydrolase/transferase  23.46 
 
 
636 aa  57.8  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05787  hypothetical protein  23.84 
 
 
877 aa  57.8  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1416  GCN5-related N-acetyltransferase  27.65 
 
 
909 aa  57.4  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.953678  normal  0.831405 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  28.57 
 
 
911 aa  57  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3343  GCN5-related N-acetyltransferase  27.04 
 
 
880 aa  57  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0598594  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1718  CoA-binding domain protein  24.1 
 
 
901 aa  57  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3841  amino acid-binding ACT domain protein  32.34 
 
 
296 aa  57  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3206  putative acyl-CoA synthetase  27.04 
 
 
880 aa  57  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3465  putative acyl-CoA synthetase  27.04 
 
 
880 aa  57  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.063853  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  29.05 
 
 
929 aa  56.6  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16050  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  30.43 
 
 
934 aa  55.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.243356 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0852  GCN5-related N-acetyltransferase  23.64 
 
 
888 aa  55.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121285  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11017  hypothetical protein  29.17 
 
 
333 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.210732  normal  0.341372 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3493  GCN5-related N-acetyltransferase  26.45 
 
 
882 aa  56.2  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4663  cyclic nucleotide-binding protein  29.73 
 
 
332 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1193  acetyl-CoA hydrolase/transferase  22.86 
 
 
623 aa  55.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000807125  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000156  protein acetyltransferase  21.85 
 
 
877 aa  53.9  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.775567  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1278  acetyl-CoA hydrolase/transferase  22.88 
 
 
634 aa  53.9  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.863753  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1004  GCN5-related N-acetyltransferase  30.46 
 
 
883 aa  54.3  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1976  acetyl-CoA hydrolase/transferase  28.06 
 
 
633 aa  53.9  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4284  cyclic nucleotide-binding protein  29.05 
 
 
332 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4370  cyclic nucleotide-binding protein  29.05 
 
 
332 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.518531  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3997  GCN5-related N-acetyltransferase  24.86 
 
 
193 aa  53.1  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0143681  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3164  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 
812 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1501  CoA-binding domain protein  26.54 
 
 
886 aa  52.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.137638  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1436  GCN5-related N-acetyltransferase  25.79 
 
 
179 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.068223 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0885  GCN5-related N-acetyltransferase  23.18 
 
 
887 aa  51.6  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1570  GCN5-related N-acetyltransferase  31.65 
 
 
177 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1135  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
179 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370812  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  26.75 
 
 
895 aa  50.4  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0615  GCN5-related N-acetyltransferase  27.67 
 
 
775 aa  50.4  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.47112  normal  0.466486 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1446  GCN5-related N-acetyltransferase  27.71 
 
 
207 aa  50.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2486  GCN5-related N-acetyltransferase  27.44 
 
 
771 aa  50.1  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0975  GCN5-related N-acetyltransferase  28.47 
 
 
517 aa  50.1  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.021927  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3848  GCN5-related N-acetyltransferase  32.64 
 
 
192 aa  49.7  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000121275  normal  0.760581 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3962  GCN5-related N-acetyltransferase  32.64 
 
 
192 aa  49.7  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00434349  normal  0.0285152 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0861  GCN5-related N-acetyltransferase  29.11 
 
 
173 aa  49.7  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1106  GCN5-related N-acetyltransferase  26.63 
 
 
179 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1123  GCN5-related N-acetyltransferase  26.63 
 
 
179 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.645372 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3448  CoA-binding domain-containing protein  31.85 
 
 
898 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401225  normal  0.714388 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3069  GCN5-related N-acetyltransferase  23.9 
 
 
887 aa  48.9  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.835722  hitchhiker  0.00746938 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0505  CoA-binding domain protein  28.48 
 
 
887 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0641  putative acetyltransferase  23.12 
 
 
894 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0517874  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3070  acetyl-CoA hydrolase/transferase  24.22 
 
 
645 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155657 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1932  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 
907 aa  48.5  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.56977  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4246  GCN5-related N-acetyltransferase  23.67 
 
 
904 aa  48.5  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  22.75 
 
 
904 aa  48.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3581  GCN5-related N-acetyltransferase  29.48 
 
 
197 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  hitchhiker  0.0000580101 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>