95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1564 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1564  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
208 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0937602  normal  0.632763 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1513  GCN5-related N-acetyltransferase  72.06 
 
 
208 aa  270  9e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000491208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6022  hypothetical protein  37.34 
 
 
344 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0534003  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1986  GCN5-related N-acetyltransferase  34.97 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.583564  normal  0.569103 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2207  GCN5-related N-acetyltransferase  39.16 
 
 
227 aa  73.2  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000126395  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5672  GCN5-related N-acetyltransferase  39.66 
 
 
372 aa  68.2  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.357223  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1311  hypothetical protein  30.95 
 
 
886 aa  65.1  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  33.11 
 
 
911 aa  64.3  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  34.15 
 
 
929 aa  63.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3787  GCN5-related N-acetyltransferase  35.04 
 
 
893 aa  60.1  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.152255  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  30.67 
 
 
915 aa  59.7  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4256  GCN5-related N-acetyltransferase  30.18 
 
 
173 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.330329  normal  0.825884 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  28.87 
 
 
921 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1469  CoA-binding domain protein  33.57 
 
 
902 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1446  GCN5-related N-acetyltransferase  32.77 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  30.36 
 
 
868 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277001  normal  0.28701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1423  CoA-binding domain-containing protein  28.74 
 
 
909 aa  55.5  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.382585  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  31.71 
 
 
892 aa  55.5  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3083  GCN5-related N-acetyltransferase  32.53 
 
 
192 aa  54.3  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.458832  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  26.42 
 
 
895 aa  54.3  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1833  CoA-binding domain protein  29.11 
 
 
903 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.415665  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1293  GCN5-related N-acetyltransferase  29.7 
 
 
173 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0051  GCN5-related N-acetyltransferase  29.09 
 
 
173 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  28.67 
 
 
892 aa  53.1  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0861  GCN5-related N-acetyltransferase  27.44 
 
 
173 aa  52.4  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6906  GCN5-related N-acetyltransferase  30.3 
 
 
175 aa  52  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1776  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
898 aa  52  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.634734 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1193  acetyl-CoA hydrolase/transferase  32.47 
 
 
623 aa  52  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000807125  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  30.18 
 
 
920 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4857  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 
201 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0619  acetyl-CoA hydrolase/transferase  41.82 
 
 
627 aa  50.4  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1570  GCN5-related N-acetyltransferase  36.49 
 
 
177 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2237  CoA-binding domain protein  27.45 
 
 
950 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0315579  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3564  CoA-binding domain protein  28.33 
 
 
902 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.695831  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0615  GCN5-related N-acetyltransferase  33.57 
 
 
775 aa  50.1  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.47112  normal  0.466486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  29.45 
 
 
918 aa  48.5  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3103  GCN5-related N-acetyltransferase  35.11 
 
 
208 aa  48.5  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5238  GCN5-related N-acetyltransferase  44.87 
 
 
900 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4771  GCN5-related N-acetyltransferase  44.87 
 
 
900 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1411  GCN5-related N-acetyltransferase  25.17 
 
 
147 aa  48.1  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000201819  hitchhiker  0.000645315 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1501  CoA-binding domain protein  28 
 
 
886 aa  47.4  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.137638  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3258  GCN5-related N-acetyltransferase  27.14 
 
 
204 aa  47.8  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.764419 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2388  GCN5-related N-acetyltransferase  31.97 
 
 
168 aa  47.8  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.521479  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4284  cyclic nucleotide-binding protein  30.11 
 
 
332 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  28.48 
 
 
883 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  43.86 
 
 
900 aa  47.4  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27480  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  30.43 
 
 
926 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  23.76 
 
 
903 aa  46.6  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4370  cyclic nucleotide-binding protein  30.11 
 
 
332 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.518531  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4663  cyclic nucleotide-binding protein  30.11 
 
 
332 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0056  GCN5-related N-acetyltransferase  26.79 
 
 
896 aa  46.2  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.145927 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1718  CoA-binding domain protein  28.39 
 
 
901 aa  46.6  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0086  acetyl-CoA hydrolase/transferase  23.72 
 
 
636 aa  45.8  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3748  GCN5-related N-acetyltransferase  25.41 
 
 
882 aa  45.8  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0223555  normal  0.236384 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1011  acyl-CoA synthetase (ADP forming)  28.57 
 
 
918 aa  45.8  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.415353  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  32.35 
 
 
926 aa  45.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000141408  hitchhiker  0.0047804 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2271  GCN5-related N-acetyltransferase  26.14 
 
 
178 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0631  GCN5-related N-acetyltransferase  24.63 
 
 
160 aa  45.1  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.947121  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1976  acetyl-CoA hydrolase/transferase  27.5 
 
 
633 aa  45.1  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3208  acetyltransferase  27.44 
 
 
911 aa  45.1  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1628  CoA-binding domain protein  33.33 
 
 
821 aa  44.7  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00866172  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3654  GCN5-related N-acetyltransferase  27.61 
 
 
795 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.035064  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1037  GCN5-related N-acetyltransferase  30.82 
 
 
887 aa  44.3  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.737751  normal  0.467815 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1904  CoA-binding  23.35 
 
 
915 aa  44.3  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2128  hypothetical protein  25.47 
 
 
907 aa  44.7  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505771  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  26.57 
 
 
897 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2710  GCN5-related N-acetyltransferase  26.06 
 
 
175 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297237  hitchhiker  0.000129512 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0400  GCN5-related N-acetyltransferase  25.26 
 
 
898 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.249053  normal  0.200769 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  28.38 
 
 
912 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5313  GCN5-related N-acetyltransferase  46.94 
 
 
900 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.653204  normal  0.891732 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0837  GCN5-related N-acetyltransferase  22.44 
 
 
176 aa  43.9  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00901347  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  26.01 
 
 
905 aa  43.9  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16050  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  25.93 
 
 
934 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.243356 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2486  GCN5-related N-acetyltransferase  31.39 
 
 
771 aa  43.1  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3256  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
298 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.14323  normal  0.203429 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2039  GCN5-related N-acetyltransferase  24.07 
 
 
900 aa  43.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.583899  normal  0.0195221 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05787  hypothetical protein  24.52 
 
 
877 aa  43.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15880  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  29.14 
 
 
831 aa  43.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00274098  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  21.56 
 
 
907 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1371  GCN5-related N-acetyltransferase  22.42 
 
 
907 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.870954  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1474  GCN5-related N-acetyltransferase  29.33 
 
 
206 aa  42.4  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.195699 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0852  GCN5-related N-acetyltransferase  25.27 
 
 
888 aa  42.4  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121285  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1832  GCN5-related N-acetyltransferase  29.73 
 
 
901 aa  42  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.52555  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  32.43 
 
 
911 aa  42  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2023  GCN5-related N-acetyltransferase  29.73 
 
 
908 aa  42  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0872701  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0831  GCN5-related N-acetyltransferase  45.45 
 
 
200 aa  42.4  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3997  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
193 aa  42  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0143681  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2228  GCN5-related N-acetyltransferase  44.23 
 
 
893 aa  42  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.00661786  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1240  GCN5-related N-acetyltransferase  46 
 
 
920 aa  41.6  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0677298  hitchhiker  0.00305841 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2102  GCN5-related N-acetyltransferase  22.46 
 
 
194 aa  41.6  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0909168  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000156  protein acetyltransferase  22.47 
 
 
877 aa  41.6  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.775567  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3581  GCN5-related N-acetyltransferase  31.41 
 
 
197 aa  41.2  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  hitchhiker  0.0000580101 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3502  GCN5-related N-acetyltransferase  34.57 
 
 
872 aa  41.2  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667038  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2035  hypothetical protein  26.39 
 
 
215 aa  41.2  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.128169 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1628  GCN5-related N-acetyltransferase  25.64 
 
 
901 aa  41.6  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>