23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2651 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2651  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  100 
 
 		 284 aa  575  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3771  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  42.49 
 
 		 274 aa  218  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.303895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4760  hypothetical protein  43.75 
 
 		 275 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.342665  normal  0.621929 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3065  hypothetical protein  43.22 
 
 		 275 aa  210  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2421  semialdehyde dehydrogenase NAD - binding  41.67 
 
 		 276 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4653  hypothetical protein  43.01 
 
 		 275 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.315155 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3119  hypothetical protein  41.7 
 
 		 278 aa  205  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757637 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2925  semialdehyde dehydrogenase NAD - binding  40.94 
 
 		 276 aa  205  6e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0087  hypothetical protein  41.03 
 
 		 276 aa  201  8e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1069  hypothetical protein  38.41 
 
 		 279 aa  188  7e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.270038  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3066  hypothetical protein  37.02 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0930986 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.92 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3480  ketol-acid reductoisomerase  30.71 
 
 		 341 aa  45.8  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.161207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.33 
 
 		 312 aa  45.8  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2218  ketol-acid reductoisomerase  26.25 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  31.97 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  30.83 
 
 		 338 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3328  ketol-acid reductoisomerase  28.69 
 
 		 324 aa  43.5  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.379867 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0393  arogenate dehydrogenase  36.51 
 
 		 313 aa  43.5  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  29.13 
 
 		 338 aa  43.5  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3229  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.32 
 
 		 312 aa  43.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.06 
 
 		 313 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1719  ketol-acid reductoisomerase  29.91 
 
 		 338 aa  42.7  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00792328  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>