18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3771 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3771  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  100 
 
 		 274 aa  556  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.303895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3065  hypothetical protein  82.18 
 
 		 275 aa  471  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4653  hypothetical protein  81.82 
 
 		 275 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.315155 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4760  hypothetical protein  81.09 
 
 		 275 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.342665  normal  0.621929 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2421  semialdehyde dehydrogenase NAD - binding  74.26 
 
 		 276 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0087  hypothetical protein  71.9 
 
 		 276 aa  408  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2925  semialdehyde dehydrogenase NAD - binding  71.32 
 
 		 276 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3119  hypothetical protein  59.71 
 
 		 278 aa  350  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757637 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1069  hypothetical protein  63.04 
 
 		 279 aa  345  6e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.270038  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3066  hypothetical protein  50.19 
 
 		 285 aa  284  1.0000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0930986 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2651  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  42.49 
 
 		 284 aa  208  6e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.56 
 
 		 308 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.3 
 
 		 313 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.18 
 
 		 272 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.09 
 
 		 312 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0898  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.19 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2212  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.37 
 
 		 311 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2527  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 		 303 aa  42.7  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>