26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1069 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1069  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  560  1.0000000000000001e-159  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.270038  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3771  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  63.04 
 
 		 274 aa  345  6e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.303895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3065  hypothetical protein  60.65 
 
 		 275 aa  344  8.999999999999999e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4760  hypothetical protein  59.06 
 
 		 275 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.342665  normal  0.621929 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0087  hypothetical protein  59.64 
 
 		 276 aa  324  8.000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4653  hypothetical protein  58.33 
 
 		 275 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.315155 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2925  semialdehyde dehydrogenase NAD - binding  58.39 
 
 		 276 aa  323  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2421  semialdehyde dehydrogenase NAD - binding  56.93 
 
 		 276 aa  317  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3119  hypothetical protein  50.18 
 
 		 278 aa  286  4e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757637 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3066  hypothetical protein  50 
 
 		 285 aa  271  8.000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0930986 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2651  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  38.41 
 
 		 284 aa  183  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0898  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.59 
 
 		 270 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0239  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  38.14 
 
 		 290 aa  49.7  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.223383  normal  0.808086 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02750  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.37 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6743  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.83 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1472  ketol-acid reductoisomerase  30.25 
 
 		 346 aa  43.9  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5408  ketol-acid reductoisomerase  30.17 
 
 		 338 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0737176  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0481  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.42 
 
 		 267 aa  43.5  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790225  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0812  ketol-acid reductoisomerase  29.06 
 
 		 338 aa  43.1  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62130  ketol-acid reductoisomerase  30.17 
 
 		 338 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0371578 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42500  ketol-acid reductoisomerase  30.77 
 
 		 338 aa  43.1  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  39.56 
 
 		 313 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.85 
 
 		 312 aa  42.7  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1267  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.9 
 
 		 291 aa  42.7  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  29.66 
 
 		 338 aa  42.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1962  ketol-acid reductoisomerase  31.62 
 
 		 339 aa  42  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.971323  normal  0.40215 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>