17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3065 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3065  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  557  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4760  hypothetical protein  89.82 
 
 
275 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.342665  normal  0.621929 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4653  hypothetical protein  89.45 
 
 
275 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.315155 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3771  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  82.18 
 
 
274 aa  471  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.303895  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2421  semialdehyde dehydrogenase NAD - binding  73.16 
 
 
276 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2925  semialdehyde dehydrogenase NAD - binding  71.32 
 
 
276 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0087  hypothetical protein  70.07 
 
 
276 aa  402  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3119  hypothetical protein  61.51 
 
 
278 aa  360  1e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000757637 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1069  hypothetical protein  60.65 
 
 
279 aa  344  8.999999999999999e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.270038  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3066  hypothetical protein  49.63 
 
 
285 aa  267  1e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0930986 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2651  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  43.22 
 
 
284 aa  199  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  25 
 
 
272 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.74 
 
 
272 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.21 
 
 
272 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.21 
 
 
272 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.64 
 
 
308 aa  43.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.21 
 
 
272 aa  42  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>