27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2421 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2421  semialdehyde dehydrogenase NAD - binding  100 
 
 		 276 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2925  semialdehyde dehydrogenase NAD - binding  82.25 
 
 		 276 aa  481  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0087  hypothetical protein  77.9 
 
 		 276 aa  444  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3771  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  74.26 
 
 		 274 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.303895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3065  hypothetical protein  73.16 
 
 		 275 aa  416  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4653  hypothetical protein  72.53 
 
 		 275 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.315155 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4760  hypothetical protein  70.33 
 
 		 275 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.342665  normal  0.621929 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3119  hypothetical protein  61.45 
 
 		 278 aa  358  4e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757637 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1069  hypothetical protein  56.93 
 
 		 279 aa  317  1e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.270038  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3066  hypothetical protein  46.32 
 
 		 285 aa  264  1e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0930986 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2651  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  41.67 
 
 		 284 aa  203  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.23 
 
 		 272 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.83 
 
 		 312 aa  50.4  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.07 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2212  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.57 
 
 		 311 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.38 
 
 		 272 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.65 
 
 		 272 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.59 
 
 		 308 aa  46.2  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.07 
 
 		 272 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.38 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.69 
 
 		 311 aa  44.3  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.93 
 
 		 276 aa  43.5  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.98 
 
 		 273 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0297  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  24.36 
 
 		 309 aa  42.7  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.57 
 
 		 321 aa  42.7  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2100  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.09 
 
 		 310 aa  42.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.82 
 
 		 321 aa  42.4  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>