26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2925 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2925  semialdehyde dehydrogenase NAD - binding  100 
 
 		 276 aa  561  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2421  semialdehyde dehydrogenase NAD - binding  82.25 
 
 		 276 aa  481  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0087  hypothetical protein  78.99 
 
 		 276 aa  447  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4760  hypothetical protein  71.79 
 
 		 275 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.342665  normal  0.621929 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4653  hypothetical protein  72.53 
 
 		 275 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.315155 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3065  hypothetical protein  71.32 
 
 		 275 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3771  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  71.32 
 
 		 274 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.303895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3119  hypothetical protein  63.27 
 
 		 278 aa  361  6e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757637 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1069  hypothetical protein  58.39 
 
 		 279 aa  323  2e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.270038  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3066  hypothetical protein  44.12 
 
 		 285 aa  253  3e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0930986 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2651  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  40.94 
 
 		 284 aa  198  7e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.51 
 
 		 272 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.93 
 
 		 272 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.91 
 
 		 272 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.51 
 
 		 272 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0297  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  25.42 
 
 		 309 aa  46.2  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.58 
 
 		 313 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.83 
 
 		 312 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.25 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2212  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.5 
 
 		 311 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.65 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1997  prephenate dehydrogenase  26.72 
 
 		 437 aa  44.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  37.5 
 
 		 311 aa  43.9  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  32 
 
 		 273 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  38.37 
 
 		 310 aa  43.5  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2945  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.59 
 
 		 313 aa  42.4  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0241407 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>