19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2407 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2407  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  413  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000815114  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0312  hypothetical protein  41.45 
 
 		 252 aa  85.5  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.228119 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2965  hypothetical protein  35.24 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00474996  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  30.81 
 
 		 272 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  30.67 
 
 		 294 aa  49.7  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6531  putative ABC transporter transmembrane protein  29.76 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.250504  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2174  hypothetical protein  32.26 
 
 		 276 aa  45.8  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.347579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  50 
 
 		 280 aa  45.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3914  ABC transporter, integral membrane subunit  28.43 
 
 		 298 aa  45.8  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  29.84 
 
 		 239 aa  45.4  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  31.09 
 
 		 279 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  29.63 
 
 		 276 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7840  integral membrane protein  43.42 
 
 		 249 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.088066 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3385  hypothetical protein  33.16 
 
 		 293 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010622  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1737  hypothetical protein  28.86 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  30.32 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0022  putative integral membrane transport protein  41.1 
 
 		 285 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1900  hypothetical protein  32.41 
 
 		 504 aa  42.4  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0528132 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  32.98 
 
 		 297 aa  42  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>