23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1986 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1986  Ig family protein  100 
 
 
608 aa  1167    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.188693  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0785  hypothetical protein  92.42 
 
 
625 aa  360  5e-98  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1887  hypothetical protein  89.45 
 
 
578 aa  348  2e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1742  SpoIID/LytB domain protein  74.87 
 
 
1032 aa  288  1e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.334202  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1977  hypothetical protein  70.49 
 
 
655 aa  256  9e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0308729  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2450  hypothetical protein  39.26 
 
 
314 aa  87.4  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.598375  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2838  hypothetical protein  35.15 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.553785  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1265  hypothetical protein  34.15 
 
 
253 aa  71.2  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00241342  hitchhiker  0.00000000126869 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3247  sugar-binding domain protein  40.28 
 
 
2375 aa  61.2  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3747  hypothetical protein  31.98 
 
 
246 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7833  hypothetical protein  31.64 
 
 
245 aa  55.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0131877 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07515  aspergillopepsin, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02970)  28.9 
 
 
270 aa  54.7  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.219297  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3357  hypothetical protein  30.49 
 
 
236 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.166412 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4946  hypothetical protein  29.55 
 
 
296 aa  52  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00230814  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1855  hypothetical protein  29.17 
 
 
395 aa  51.2  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0638  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.22 
 
 
878 aa  51.2  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.167196  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4498  Ig family protein  36.97 
 
 
1232 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.38 
 
 
1072 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  47.89 
 
 
1222 aa  48.1  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3316  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.11 
 
 
692 aa  48.1  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1170  hypothetical protein  28.51 
 
 
334 aa  47.8  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  34.27 
 
 
1672 aa  46.2  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.94 
 
 
933 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>