11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0785 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0785  hypothetical protein  100 
 
 
625 aa  1199    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1887  hypothetical protein  93.73 
 
 
578 aa  480  1e-134  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1986  Ig family protein  92.89 
 
 
608 aa  360  4e-98  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.188693  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1742  SpoIID/LytB domain protein  74.31 
 
 
1032 aa  303  5.000000000000001e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.334202  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1977  hypothetical protein  65.06 
 
 
655 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0308729  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3899  hypothetical protein  49.25 
 
 
268 aa  65.1  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3823  hypothetical protein  41.89 
 
 
308 aa  57  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4987  hypothetical protein  33.75 
 
 
216 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0786156  hitchhiker  0.0064224 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2762  hypothetical protein  23.26 
 
 
527 aa  56.2  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3648  hypothetical protein  33.71 
 
 
282 aa  48.9  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0847  hypothetical protein  39.39 
 
 
287 aa  45.8  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>