19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0457 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0457  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
384 aa  776    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.95822  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2320  tetratricopeptide domain-containing protein  30.36 
 
 
229 aa  139  6e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1739  hypothetical protein  36.73 
 
 
231 aa  122  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1100  hypothetical protein  32.57 
 
 
221 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.228679  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2231  hypothetical protein  30.23 
 
 
238 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.938381  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1061  hypothetical protein  30.88 
 
 
228 aa  103  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1682  hypothetical protein  28.44 
 
 
230 aa  95.5  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0349  hypothetical protein  33.03 
 
 
218 aa  93.6  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00317659  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0367  hypothetical protein  33.03 
 
 
218 aa  93.2  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.090753  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1556  hypothetical protein  32.75 
 
 
222 aa  90.1  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1598  hypothetical protein  24.64 
 
 
407 aa  84  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.303519  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1769  uncharacterized protein-like protein  29.86 
 
 
218 aa  82  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00195397  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1865  hypothetical protein  30.46 
 
 
175 aa  77.4  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0259041  normal  0.0449521 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0153  hypothetical protein  29.95 
 
 
222 aa  57  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1715  uncharacterized protein-like protein  25.12 
 
 
220 aa  55.1  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0306638  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3293  hypothetical protein  25.4 
 
 
276 aa  53.1  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0451573  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  29.63 
 
 
228 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.37 
 
 
228 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 
242 aa  42.7  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>