16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3293 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3293  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  568  1e-161  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0451573  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1682  hypothetical protein  35.68 
 
 
230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1061  hypothetical protein  33.94 
 
 
228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1100  hypothetical protein  32.34 
 
 
221 aa  103  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.228679  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2231  hypothetical protein  28.24 
 
 
238 aa  89.7  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.938381  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1739  hypothetical protein  25.89 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1769  uncharacterized protein-like protein  29.22 
 
 
218 aa  76.3  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00195397  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1556  hypothetical protein  28.11 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2320  tetratricopeptide domain-containing protein  24.2 
 
 
229 aa  69.3  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0349  hypothetical protein  25.85 
 
 
218 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00317659  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0367  hypothetical protein  25.85 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.090753  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1598  hypothetical protein  24.4 
 
 
407 aa  67  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.303519  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1715  uncharacterized protein-like protein  25.37 
 
 
220 aa  53.5  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0306638  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1865  hypothetical protein  26.55 
 
 
175 aa  50.4  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0259041  normal  0.0449521 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0107  Protein of unknown function DUF2225  38.82 
 
 
293 aa  49.7  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0457  cyclic nucleotide-binding protein  32 
 
 
384 aa  47.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.95822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>