19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2320 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2320  tetratricopeptide domain-containing protein  100 
 
 
229 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2231  hypothetical protein  31.96 
 
 
238 aa  135  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.938381  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1100  hypothetical protein  35 
 
 
221 aa  125  7e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.228679  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1739  hypothetical protein  32.31 
 
 
231 aa  123  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0457  cyclic nucleotide-binding protein  30.36 
 
 
384 aa  121  9e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.95822  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1682  hypothetical protein  32.56 
 
 
230 aa  118  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1061  hypothetical protein  33 
 
 
228 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1769  uncharacterized protein-like protein  29.2 
 
 
218 aa  94.7  9e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00195397  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1556  hypothetical protein  24.89 
 
 
222 aa  90.9  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0367  hypothetical protein  25 
 
 
218 aa  77.8  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.090753  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1865  hypothetical protein  25.86 
 
 
175 aa  77.8  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0259041  normal  0.0449521 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0349  hypothetical protein  25 
 
 
218 aa  77.4  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00317659  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3293  hypothetical protein  24.2 
 
 
276 aa  69.3  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0451573  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1598  hypothetical protein  25 
 
 
407 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.303519  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0153  hypothetical protein  26.64 
 
 
222 aa  56.2  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02676  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.82 
 
 
847 aa  45.1  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0283  hypothetical protein  26.67 
 
 
217 aa  44.3  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0181263  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2274  hypothetical protein  29.12 
 
 
291 aa  43.1  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.326143  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1715  uncharacterized protein-like protein  22 
 
 
220 aa  42.7  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0306638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>