19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1556 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1556  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1769  uncharacterized protein-like protein  47.75 
 
 
218 aa  199  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00195397  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0367  hypothetical protein  39.82 
 
 
218 aa  150  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.090753  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0349  hypothetical protein  39.38 
 
 
218 aa  150  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00317659  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1061  hypothetical protein  33.17 
 
 
228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2231  hypothetical protein  34.53 
 
 
238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.938381  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1682  hypothetical protein  32.27 
 
 
230 aa  105  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1100  hypothetical protein  31.28 
 
 
221 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.228679  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1739  hypothetical protein  31.68 
 
 
231 aa  96.7  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2320  tetratricopeptide domain-containing protein  24.89 
 
 
229 aa  90.9  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1715  uncharacterized protein-like protein  31.48 
 
 
220 aa  86.7  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0306638  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0457  cyclic nucleotide-binding protein  31 
 
 
384 aa  79.3  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.95822  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1598  hypothetical protein  23.53 
 
 
407 aa  79  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.303519  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3293  hypothetical protein  28.11 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0451573  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1865  hypothetical protein  27.78 
 
 
175 aa  57.4  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0259041  normal  0.0449521 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0153  hypothetical protein  25.65 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0283  hypothetical protein  27.15 
 
 
217 aa  47  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0181263  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0107  Protein of unknown function DUF2225  32 
 
 
293 aa  46.6  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.36 
 
 
395 aa  43.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.127314 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>